一隻懂金融的HIV如何對沖它的籌碼
Weinberger團隊使用數學建模、成像和遺傳學相結合的方式證明,HIV選擇性剪接發生在轉錄後。曾經,科學家們認為,剪接(splicing)發生在轉錄同時,這項研究提出異議,揭示了第一個轉錄後剪接。
幹細胞是一種具有無限可能的細胞。過去幾十年來,科學家們一直困惑幹細胞如何在保持幹細胞狀態、繼續分裂和專門化為特定細胞類型之間抉擇。
有意思的是,HIV同樣也面臨相同抉擇:什麼時候開始增殖;什麼時候關閉隱藏,以備來日捲土重來。
「像你運用多樣化的金融方法投資,生物學也可以用類似的方式對沖賭注,」Gladstone 研究所細胞電路中心主任Leor S. Weinberger博士解釋。「通過分散投資高風險、高收益股票和其他低風險、低收益的儲蓄產品,有助於投資者抗擊市場波動。類似地,HIV也處於一個波動的環境,它同時製造活躍和休眠感染。」
然而,如果HIV僅是在這兩種命運之間隨機切換的話,它又是如何保持在其中一種狀態的呢?Weinberger實驗室正式回答了這個長期存在的問題。他們的發現發表在著名科學期刊《Cell》。
惟利是圖的病毒
保持在活躍或潛伏狀態讓HIV持續獲益。
活躍狀態讓病毒感染更多細胞,潛伏狀態讓病毒悄無聲息地長期存活。抗逆轉錄病毒藥物對處於待機狀態的潛伏病毒無效,一旦藥物停止,這些病毒就會被迅速激活。由於無法徹底絞殺潛伏病毒,HIV不能根治。
此前,Weinberger課題組證明,HIV利用基因表達的隨機波動生產這兩類病毒。「即使兩個細胞內的基因完全相同,一個可能傾向生產大量蛋白質,另一個卻產量較小,」Weinberger實驗室的博後學者、共同一作Maike Hansen說。「這種隨機波動被稱為『噪音(noise)』,絕不能忽視噪音的作用,因為它可以決定細胞命運和功能。」
HIV為了表達它的基因,使用了一種被稱為選擇性剪接的機制,本質上是病毒切割部分基因組,然後將它們排列成不同組合。實時觀察單個細胞,研究人員發現,HIV劫持了 一種奇異的剪接形式來調整它的隨機噪音。而噪音的調節決定了病毒保持活性或潛伏性。
「我們發現HIV使用了一段特別低效的拼接形式,」Hansen說。「令人驚訝的是,如果它變得高效起來,細胞就會生產低活性的病毒。看似浪費能量的低效率過程,實際上是更好地『督促』HIV維持活躍狀態決定。」
Weinberger團隊使用數學建模、成像和遺傳學相結合的方式證明,這種選擇性剪接發生在轉錄後,在此期間,DNA的遺傳信息被複製為RNA分子。曾經,科學家們認為,剪接(splicing)發生在轉錄同時,這項研究提出異議,揭示了第一個轉錄後剪接。
HIV靶向治療策略
「剪接電路提示了一個與眾不同的HIV治療策略,」Weinberger說。「過去一段時間,有人提出『鎖定HIV』潛伏期,阻止其重新激活的目標,但如何做到這一點,無人曉得。」
如今,研究人員打算利用病毒剪接電路不斷迫使HIV回到潛伏期,實現「鎖定和阻斷」療法。
後記
這種生物學新基本機制的揭示對其他領域具有更廣泛的意義。約10-20%基因可能發生低效剪接,這些電路可用於最小化基因表達的隨機波動,從而解釋其他生命體的決策指導方針。
原文標題
A Post-Transcriptional Feedback Mechanism for Noise Suppression and Fate Stabilization


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