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用環境DNA 來有效和準確地測量生物多樣性

本周《通訊-生物學》發表的一項研究Acidity promotes degradation of multi-species environmental DNA in lotic mesocosms描述了環境DNA (eDNA) 在自然環境里的持久性和影響其持久性的因素。

準確測量生物多樣性對管理環境,研究生態系統功能和觀察頻臨滅絕的動物起重要的作用。而分子測量eDNA是最近興起的測量生物多樣性的方法。比起傳統的方法,它不需要太多的專業的操作,而且快速,經濟,沒有侵襲性。譬如,通過分析eDNA來觀察頻臨滅絕的動物時,就不再需要把動物捕捉、囚禁、取樣和放回,因為在動物生長的環境里採集的eDNA會包含動物的DNA。

儘管eDNA分析的應用日漸廣泛,這個方法仍有很多不確定和未知的因素,因為它的樣本是取自一些流動的和充滿變數的環境 ,比如湖和河流。

班戈大學的Simon Creer及同事使用了四個高地流水的、有酸鹼梯度的圍隔生態系統,來測量各種環境DNA在不同的時間和空間里的降解程度。他們發現,eDNA的持久性只有2天, 而且酸性環境會加速它的降解。 綜上所述,他們的實驗結果為研究影響流水裡的環境DNA到因素提供了一個預計的時空框架, 為有效和準確地用eDNA 來實時測量生物多樣性做出了貢獻。

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