鹿角珊瑚基因組揭示其對環境變化適應
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05-23
鹿角珊瑚基因組揭示其與海葵分化的時間、對共生藻的代謝依賴、固有免疫特徵、基因進化與鈣化等信息。
分化
鹿角珊瑚的基因大約為420Mbp,與海葵的基因的大小相似。
用珊瑚蟲的精子測序,這個基因組含有大約39%的胞嘧啶與鳥嘌呤,23688個基因。
93%的指形鹿角珊瑚基因在其他後生動物中具有匹配性,其中11%僅在珊瑚的表達序列標籤(EST)數據中有明確的同源性。
根據化石記錄,約2.4億年前首次出現造礁石珊瑚。
二疊紀-三疊紀滅絕事件
時間:2.5億年前
事件:70%的陸生脊椎動物,96%的海中生物消失,
這次滅絕事件也造成昆蟲的唯一一次大量滅絕:計有57%的科與83%的屬消失
雖然這裡展示的分析並沒有嚴格地排除了指形鹿角珊瑚內Cbs的活動的出現,但提出了一種有趣的可能性,即基於指形鹿角珊瑚專性共生的新陳代謝。
Usingthe acropora digitifera genome to understand coral responses to environmentalchange. Nature, 2011, 476: 320-323.
華東師範大學 本科生:姚啟慧、高琳


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