動物基因組界的霸者

上一期組學君帶您領略了植物王國中擁有雙重身份的「小矮人-大個子」，今天，我們繼續暢遊大型基因組的下一站，一起來看看動物基因組界的霸者吧~

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肺魚

肺魚是一種和腔棘魚類相近的淡水魚。肺魚的鰾的構造很像肺，可以進行氣體交換。對於絕大多數魚類而言，鰾的作用主要在於幫助魚上浮或下沉，增強平衡性，而呼吸則通過鰓來完成。而肺魚的特別之處就在於，它不僅能通過鰓來呼吸，也能通過鰾來呼吸。這使得肺魚可以在沒有水的環境下，也能存活很長一段時間。這種魚甚至比恐龍更古老，是現存的「活化石」。它們的基因組通常很大，其中斑紋肺魚的基因組甚至高達130Gb。

肺魚分三個科，即非洲肺魚科、美洲肺魚科和澳洲肺魚科。非洲肺魚和南美肺魚可生長在乾旱季節很長的地方。旱季來臨時，肺魚會在土裡挖個洞，呼吸空氣，進入「休眠」狀態。直到雨季的到來，它們會從洞里爬出，又恢復正常的生活方式。研究表明，有些肺魚甚至能在這種休眠狀態下生存長達5年之久。

澳洲肺魚是現代肺魚中最大的種類。體長可達125厘米，重達10千克。體呈長梭形，覆蓋大而薄的圓鱗。澳洲肺魚是肺魚中唯一不能離水生存的，但其相對於其他魚類，在流動緩慢的缺少氧氣的水域也能正常存活。

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螈

螈類動物最早出現在早侏羅世。該類動物屬兩棲綱有尾目，有斷肢再生能力。螈類動物大多擁有龐大的基因組。

藍點鈍口螈幼體水棲，成體棲息於潮濕環境，僅繁殖期返回溪水中產卵。以節肢動物、螺類、小魚、蝌蚪和幼蛙為食。視覺差，捕食主要憑嗅覺或側線。肢、尾殘損後可再生。

中國瘰螈是兩棲動物，是中國的特有物種。全長才26-150毫米。棲息于山溪緩流中，冬季居深水處。傍晚留散或集群於溪流邊，以螺螄等小型動物為食，耐飢力強。產卵期在7-8月，產卵量200枚左右。

美西鈍口螈俗稱六角恐龍，是兩棲類動物。頭部寬大，眼小，不好動。皮膚光滑無鱗，表皮角質層薄並定期蛻皮。多變的體色也是美西鈍口螈的魅力之一，常見的有普通體色、白化種、金黃體色和全黑體色。

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磷蝦

南極磷蝦是似蝦的無脊椎動物，生活在南極洲水域，有生物螢光器官，可以發光。它們體型雖小（~6cm），卻擁有很大的基因組。它們以微小的浮游植物如硅藻等為食。南極磷蝦是南冰洋生態系統中的重要物種，含量豐富，並且為鯨魚、海豹、企鵝、信天翁及其他的鳥類提供了重要的食物來源。

2018年1月，Nature在線發表了基於PacBio測序和BioNano光學圖譜測序組裝的美西鈍口螈基因組，該研究通過開發新演算法MARVEL，實現了對大型基因組低深度三代測序組裝，是迄今組裝完成的最大的基因組。基因組信息顯示，內含子和基因間區的極大擴張形成了美西鈍口螈如此大規模的基因組。

利用最新的長讀長測序技術有望快速準確地解碼這些古老動物的大型基因組，將為物種進化、斷肢再生等研究提供基因組學基礎。未來組攜最新的Oxford Nanopore、PacBio測序技術和BioNano光學圖譜等，同時配備高水平生信分析團隊，致力於為您提供高質量、高準確度的物種測序組裝分析服務。

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