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網友Coolwulf的乳腺癌X光片AI早篩項目:免費使用 準確度高達90%

網友 Coolwulf (在cnBeta熟悉他的人可能都上了年紀了,他就是K-MeleonCCF瀏覽器的作者) 在 V2EX 上發文稱,為了提升乳腺癌 X 光片的早期診斷速度,他特地提供了一個完全免費的網站和 iOS app 。起因是去年一位 34 歲的校友因乳腺癌晚期不幸離世,留下了一個才 4 歲的孩子。

惋惜之餘,他思索著能不能做點什麼事情,幫助大眾來提高乳腺癌的早期檢測成功率。因為如果在一期發現乳腺癌的話,5 年存活率高達 99% 。

正常(左)與癌性(右)乳房造影圖像【來自:維基百科】

那麼,能否寫一個完全免費的網站和 ios app,讓用戶可以迅速得到「乳腺 X 光片」(X-ray Mammogram)的診斷結果、或者至少可以是 2nd Opinion?

因為用戶做完 Mammography 之後有時候需要等好幾天才能有放射科醫師(Radiologist)來讀片子,而且現在有 20% 的概率會漏掉早期的腫瘤。

有鑒於此,Coolwulf 決定用 Deep Learning (深度學習) 來做這件事情。

對於一個足夠好的深度學習模型(Deep Learning Model),一是要有足夠多的數據(即使是做 Transfer Learning 的情況下),二是要有足夠強大的計算力。

為了做成這件事情,我在本地搭建了一個 50 個 Nvidia Geforce GTX 1080 Ti 的 GPU 集群,這是搭成之後的硬體:

有了硬體之後就是設計 Model 和收集數據。我從北美和歐洲的幾個研究組獲取了「帶注釋的乳腺 X 光片」(Annotated Breast Mammo)的數據。

這些 Annotation 大多都是根據北美 ABR 認證的放射學者做出的。也就是說,如果這個模型能夠訓練好,就可以達到 ABR Certified Radiologist 識別的平均水平或者更好。

最終的結果我在歐洲的 InBreast 數據上做了測試,達到了 90% 的準確度(AUC)。

我覺得這個 Model 已經可以給大眾實用了,在這裡公開出來:

http://neuralrad.com

你可以直接上傳 .jpg 形式的 Mammo 圖片,這個 AI 會給出判斷結果(下面是屏幕截圖):

這個網站是完全免費使用的。我現在還在繼續更新和改進模型,也在聯繫國內的幾家醫院來合作來獲取更多的數據來訓練它。

肯塔基大學醫院(University of Kentucky Hospital)和國內的一家合作公司已經在測試了這個模型。

乳腺癌檢查去年有個全世界競賽,他們先用這個競賽獲得第二名程序測試了 MIAS 數據,漏了 10 個 case,然後他們用我的網站測試了一下,只漏了一個。

這個第二名程序發表了一篇自然雜誌的論文:

這兩天,我也公布了完全免費的桌面版本,支持讀取和瀏覽 dicom 文件,並自動轉換 Normalize for AI analysis 。

在 InBreast 的 Dicom 數據上,AUC (準確率)大概 93% 。上面為桌面版本截圖,下載地址就在網頁主頁上。


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