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數百微生物基因組草圖繪成

科技日報北京6月14日電 (記者張夢然)英國《自然》雜誌14日在線發表的一項微生物學最新成果,美國科學家團隊繪製完成數百個非培養且未被研究過的微生物基因組草圖,並鑒定出了一千多個生物合成基因簇。研究表明,土壤中的細菌極有可能代表了一種有待開發的新型抗生素,以及其他藥用化合物的來源。

細菌在與抗生素的博弈中,已經變得越來越厲害。抗生素本質上是微生物(包括細菌、真菌、放線菌屬)或高等動植物在生活過程中所產生的一類次級代謝產物,具有抗病原體或其他活性的作用,會干擾其他細胞的發育功能。目前科學界認為,遏制耐藥性感染增多趨勢,需要全新的抗生素。但過去30年里,僅有非常少量的新抗生素被開發出來,人們急需新的抗生素來對抗多葯耐葯型病原體。

美國加州大學伯克利分校研究人員朱利安·本菲爾德及其同事,此次成功繪製出了數百個非培養且基本未被研究過的微生物的基因組草圖,這些微生物來自加利福尼亞州北部一片草原的土壤生態系統。隨後,研究團隊鑒定出了一千多個生物合成基因簇,推測它們可合成一系列分子,包括各種肽、抗菌毒素和功能不明的其他代謝物。這些基因的表達因土壤樣品採集的深度和位置而有所不同,反映了它們對不同環境條件的生物反應。

已知土壤中的微生物會產生多種有用的次級代謝物,包括抗生素、抗真菌劑和免疫抑製劑,但是它們大多數都來源於少數培養的微生物群。而今這項研究擴大了這些分子的潛在來源範圍,甚至還發現了兩個以前未知的、具有異常強大生物合成能力的細菌種類。此外,這項研究也提出了土壤微生物使用這種複雜的化學語言相互溝通的可能性。

總編輯圈點

上世紀40年代,青黴素出現後改變了世界——抗生素讓許多以往的不治之症可以被治癒。但隨之,病毒也在持續進化併產生耐藥性。人們認為,唯一有效辦法是製造新的抗生素出來——這需要大量相關的基礎研究來確認產生抗生素的微生物,包括檢查上千種不同樣本,培養、篩選並確定其不是老抗生素。亦因此,數百個未被研究過且非人工培養的微生物基因組草圖,才被視作全新抗生素出現的希望。

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