人類與微生物的戰爭節節升級，人類還處於弱勢

微生物無處不在。它們通常不被肉眼所見，卻富含在我們呼吸的空氣中、土壤里、水中、我們的皮膚和頭髮上、我們的口腔和腸道里、我們吃的食物內外。它們使土壤肥沃，使環境清潔。它們改變(通常是改善)我們的食物。其中有些保護我們免受有害微生物的侵犯。然而，大多數人幾乎意識不到它們的存在，除非他們生了病。

老鼠和蟑螂雖然令人討厭而且繁殖力特強，但基本上沒有希望發展到使人類束手無策的地步。大型猛獸對單個人來說固然可怕，但對人類整體的威脅微乎其微，事實上我們已經要拚命保護它們的生存了。

微生物是可怕的，體積大的生物反而不容易成為人類的對手。

微生物對人類最重要的影響之一是導致傳染病的流行。在人類疾病中有50％是由病毒引起。例如，微球菌能使人的頭部生白斑，銅綠色假單胞菌與支氣管炎、咽炎和耳、鼻、眼的炎症有關。

在人們開始大規模聚居而公共衛生及排水系統尚未發展起來的時代，烈性傳染病曾經進行過人類史上最可怕的屠殺，它能夠一次殺死全球1/3的人口。微生物在幾分鐘或幾天內就能繁殖一代，人類至少需要十幾年，依靠進化與它們對抗基本上是沒有指望的。

但人類正不斷地研製出新葯，更重要的是，良好的公共衛生服務能夠切斷傳染源，把疫情控制在小範圍內。因此，如果沒有發生意外事件導致社會正常運作全盤崩潰，傳染病一般不會造成大規模災難。不過，烈性傳染病的退場，使艾滋病這類傳染能力相對較弱但傳染途徑特殊的疾病有了一展身手的機會，成為新的棘手問題。

在微生物的發現之旅中，我們仍需長途跋涉。我們非常擅長發現哪種微生物會在一個特定的生態系統中繁殖，但在某種程度上，我們還不知道它們在做什麼，它們之間如何進行交流，它們如何與我們交流。我們也不知道擾亂它們會給我們帶來怎樣意想不到的後果，是用抗生素來消滅這些有害的微生物，還是通過調整飲食、調節與其他人和動物的聯繫或者改變我們與環境的聯繫，讓新的微生物介入進來？

我們面臨的很大一部分挑戰是我們的微生物組每天都在改變——從本質上說，我們任意一個間接的行為，都會改變我們的微生物組。微生物科學的偉大力量，就出現在我們為了實現完整生態系統的預期效果而明白我們需要做什麼的時候。

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