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產NDM-1合併外膜孔蛋白缺失肺炎克雷伯菌的爆發流行

腸桿菌科細菌對碳青黴烯類藥物的耐葯機制主要包括:1、產碳青黴烯酶;2、ESBLs和/或AmpC酶過度表達,同時合併外膜孔蛋白(OMP)的丟失。產碳青黴烯酶是腸桿菌科細菌對碳青黴烯類耐葯的最主要機制。其中,新近發現的以NDM型為代表的金屬碳青黴烯酶(MBL)是當前耐葯機制研究中的熱點,它能水解除氨曲南以外的所有β-內醯胺類,包括碳青黴烯類。

2018年發表於Microbial Drug Resistance上的一篇報道顯示:在突尼西亞CharlesNicolle醫院發現了19株產NDM-1的肺炎克雷伯菌爆發,分別由兩個屬於ST147和ST307的克隆引起,其中外膜孔蛋白的缺失在碳青黴烯耐葯中可能發揮重要作用。研究人員對這19株NDM-1陽性肺炎克雷伯菌引起爆發流行的臨床和分子特徵進行了描述,並對OMP缺失對碳青黴烯耐藥水平的影響進行了分析。

研究方法

收集2010-2015年該院臨床分離的178株碳青黴烯類耐葯腸桿菌科細菌(Carbapenem-resistantEnterobacteriaceae,CRE);採用IMP-EDTA協同試驗篩查MBL產生株;PCR方法檢測耐葯基因和毒力因子;PFGE和MLST方法對菌株進行基因分型;通過PCR圖譜確定產碳青黴烯酶基因的遺傳環境;進行接合試驗,並通過PCR方法對質粒進行複製子分型;十二烷基硫酸鈉-聚丙烯醯胺凝膠電泳法(SDS-PFGE)分析外膜孔蛋白OmpA-like、OmpK35及OmpK36的表達,並對其編碼基因進行測序分析。

研究結果及討論

從4個不同病區住院患者身上共分離出19(10.6%)株具有金屬碳青黴烯酶活性的肺炎克雷伯菌,PCR及葯敏結果顯示所有菌株均攜帶多種耐葯基因而表現出泛耐葯的表型。其中blaNDM-1為唯一檢出的MBL,3株細菌同時攜帶有blaOXA-48;基因分型顯示19株細菌分屬於A、B兩個PFGE型別,其中16株細菌為ST147型,3株細菌為ST307,提示blaNDM-1的流行病學擴散歸因於ST147和ST307兩個克隆;接合試驗及測序結果顯示,blaNDM-1位於IncFIA型接合質粒中,blaNDM-1基因上游存在插入序列ISAba125,下游存在博來黴素抗性基因bleMBL,blaOXA-48基因位於轉座子Tn1999中;SDS-PFGE蛋白電泳顯示所有菌株均存在OMP缺失,並且OmpK35和OmpK36缺失菌株中碳青黴烯耐藥水平顯著升高,提示外膜蛋白缺失在CRE菌株對碳青黴烯類抗生素耐葯過程中發揮了重要作用。

研究結論

本研究描述了一起發生於突尼西亞的由產NDM-1肺炎克雷伯菌引起的爆發流行,並強調OMP缺失結合β-內醯胺酶的表達可能引起肺炎克雷伯菌對碳青黴烯類藥物的高水平耐葯。

摘譯:李鑫 陸上 王蕾蕾

審校:陳軼堅


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