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研究發現肝細胞癌特異的診斷標誌物

近日,國際學術期刊Genome Medicine在線發表了中國科學院上海營養與健康研究院李亦學研究組題為Integrative analysis of DNA methylation and gene expression reveals hepatocellular carcinoma-specific diagnostic biomarkers 的最新研究成果。該研究系統研究了肝癌相比其它腫瘤的特異性標誌物,為未來肝癌早診斷提供了一種新的解決方案。

肝癌是世界上最常見的和最致命的疾病之一,多數肝癌在診斷時已屬於晚期,因此肝癌的早期診斷是延長病人生存時間的關鍵。以往研究表面癌症發生早期和進展過程中,都存在DNA甲基化的變化。通過檢測血液中DNA甲基化水平的變化,可能發現早期的癌症。

李亦學組的李虹、程錦明等通過比較375個肝癌組織、50個正常肝組織、184個健康人血液,以及3780個其它癌症患者的甲基化圖譜,篩選出了肝癌中特異高甲基化的位點。基於這些位點使用Logistic回歸建立了肝癌預測模型,對三套獨立數據集(327個HCC和122個正常樣本)和10個臨床病人樣本進行評估。結果表明肝癌預測模型對肝癌的預測靈敏度達到92%,並能排除98%的正常肝組織和其它類型的癌症。與已發表的肝癌甲基化標誌物相比,研究人員找到的標誌物是唯一可以將HCC與其它癌症區分開的。基於該項發現的後續研究已經展開。

該工作得到了科技部和國家自然科學基金委的相關資助。

基於DNA甲基化的肝癌預測模型的準確率

文章來源:上海營養與健康研究院

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