新突破!世界首個蚶科全基因組精細圖譜組裝完成
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07-06
基因組繪製
近日,浙江省海洋水產養殖研究所貝類團隊完成了泥蚶基因組精細圖譜的測序和組裝工作,這是世界上蚶科生物第一次完成基因組繪製。
那麼問題來了,
全基因組測序工作有啥用呢?
全基因組測序工作的完成,好比繪製了一張泥蚶的基因地圖,科學家可以按圖索驥,培育更優質、高產或抗病的新品種,育種周期也將大大縮短。
泥蚶在我國沿海皆有分布,其風味鮮美,肉質細嫩,曾被作為海中珍品,具有較高的市場價值。近年來,隨著人們生活水平的提升,泥蚶等灘涂貝類水產品的質量越來越受到關注,選育高品質的貝類新品種成為貝類團隊下一步研究的主攻方向。
然而,傳統的育種技術受繁殖周期長等限制影響了泥蚶等水產品育種研究的進展。全基因組選擇育種直接從基因水平進行選擇,可以快速推動泥蚶等灘涂貝類育種的進程。
泥蚶與另外六個物種基因組的基因組成比較
浙江省海洋水產養殖研究所貝類研究團隊採用第二代測序與第三代測序結合的方法進行泥蚶全基因組測序,在被檢測的978個直系同源基因中,有93.5%組裝得到完整的基因,解決了泥蚶基因組雜合度高組裝難的技術問題。
泥蚶全基因組的注釋流程
此次獲得的泥蚶基因組質量優於已發表的貝類其它物種。高質量泥蚶全基因組的獲得將為泥蚶重要經濟性狀的解析和全基因組選擇育種提供有力支撐。
以全基因組育種技術為基礎,浙江省海洋水產養殖研究所貝類研究團隊以泥蚶作為灘涂雙殼貝類代表性研究物種,以期建立一套適合灘涂雙殼貝類新品種快速培育的技術和方法體系,為國內灘涂貝類產業的可持續發展提供技術支撐。
來源:浙江省海洋水產養殖研究所
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