最詳細的進化樹分析過程

打開MEGA軟體，我用的版本為7.0：

點擊Align，再選擇第一個條目（edit/build Alignment）

再點擊OK即可：

上面的圖標根據自己的數據選擇數據類型，我的是DNA序列，所以點擊第一個DNA：

接著點擊edit，按下面滑鼠的位置進行點擊：

緊接著選擇自己的文件就可以了（這裡的文件可以是單個文件，也可以是多個文件，只看自己有沒有必要進行合），讀入數據文件出現：

下來就是比對了,按下面的滑鼠過程進行操作即可：

點擊完出現：

如果沒有特殊要求就按默認條件執行，點擊OK：

因為數據稍微多一點，所以比對的時候比較慢，比對完呈現：

可以看到比對完之後序列兩端是不整齊的，怎麼辦呢，一般是把沒有比對齊的首先選中，然後按delete刪除即可（當然，其實是不用刪除也可以，這裡好多人以為一定要把不對齊的鹼基刪除，其實不刪也不影響進化樹結果，因為本軟體做進化樹時自動只檢索匹配對

齊的，手動刪不刪無所謂）

現在要把比對完的文件保存為mega format（因為做進化樹的文件就是這個格式），文件名隨便，這裡我起名1.11111：

保存之後會在軟體的最上面出現mega format文件名字的（就是以.meg結尾的）：

按滑鼠所在的位置進行點擊，進入製作進化樹步驟：

選擇剛剛保存的.meg文件：

部分顯示為：

詳細的修飾功能下期待續........有問題的可以留言處交流學習。

【參考文摘】

百度

MEGA官方文檔

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