Nature Reviews：微生物群與現代世界的隔絕

Kumar N, Forster SC. Genome watch: Microbiota shuns the modern world. Nat Rev Microbiol. 2017 Dec;15(12):710.

人類的消化道像一個水庫，包含有數萬億的細菌和數百個種類的微生物。胃腸道內微生物的組成關係著人類健康的方方面面。從「人類微生物組計劃」（Human Microbiome Project，HMP）建立至今，已經研究了許多不同人群中胃腸道細菌群落的特徵。第一次基於16S核糖體RNA擴增子的胃腸道微生物組研究即表明，狩獵-採集人群與工業化人群相比，微生物群的組成存在明顯差異。Schnorr等的研究對27名坦尚尼亞的哈扎族獵人、馬拉維的2個農村地區共22名農夫、11名布吉納法索的莫西族兒童和三組來自工業社會的人群隊列的微生物群組進行了比較。研究發現，相較於工業社會個人的微生物群組，哈扎族人攜帶的微生物群組與來自農村的人群攜帶的微生物群組更為接近，這說明環境和生活方式對人體微生物有著重要影響。對比來自農村和工業社區的微生物，狩獵-採集者的微生物群富含密螺旋體屬，未分類的擬桿菌和瘤胃菌，而雙歧桿菌（放線菌）則不存在。

先前的研究主要集中在單一樣本的研究，但是，最近Smits等進行了一項大樣本的研究，他們在20個月中收集了188名哈扎族人的350份糞便樣本。胃腸道菌群的微生物細節特徵表明，當食譜出現季節性的變化，微生物群組也會隨之變化。在雨季，哈扎族的以植物性食物為主，在旱季，則以動物性食物為主。縱向的樣本檢測顯示，旱季相關的菌群會在旱季復甦，並與以後旱季的菌群並無二致。與雨季相關的微生物群相比，在旱季相關的微生物群具有分類多樣性和功能多樣性的特點。有趣的是，雨季菌群中的普氏菌屬、柔嫩梭菌屬、密螺旋體屬之間的關係與現在植物性食物為主的飲食群體菌群相類似。然而，雙歧桿菌屬這一在現代植物源性和動物源性食物為主的群體中都能檢測到的菌種，在哈扎族群中沒能發現。既往研究表明生活方式在驅動微生物群組成方面的潛在作用，本項研究表明飲食也具有重要作用。

胃腸道微生物群的分類組成可能因環境暴露而改變；然而，物種之間的冗餘功能可以使功能容量保持恆定。Smits等在36個選定樣本中使用鳥槍宏基因組測序和代謝組學方法檢查了與微生物群組成變化相關的功能能力的變化。有趣的是，與工業化人群隊列的HMP樣品不同，哈扎族微生物組中代謝植物碳水化合物的碳水化合物活性酶富集。既往已有研究顯示，以老鼠為模型，低纖維飲食是工業化群體微生物群中細菌多樣性減少的主要原因。類似地，抗生素抗性基因在HMP群組中比在哈扎族群體樣本中更加多樣化，支持了使用抗微生物劑影響工業化群體中胃腸道微生物群的組成的假設。

研究將有不同的飲食和生活方式的不同個體的微生物群落進行比較，為飲食和環境在塑造這些生態系統中的作用提供了重要的見解。來自傳統的狩獵者社會，農業社區和城市環境中的個人的一系列進一步詳細研究將使我們進一步了解細菌多樣性和人類胃腸道微生物群的功能。 這項研究對於了解人類腸道微生物群動態以及監測該生態系統中與人類生活方式相關的未來損失至關重要。

作者：消化客

來源：江蘇省人民醫院消化科

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