如何用ImageJ對條帶進行定量分析？

ImgaeJ是一款比較常用的科研圖片分析軟體，在之前已介紹過用它來進行細胞計數、不同顏色通道的熒光照片的融合和不規則區域面積的測定等（參見拓展閱讀部分）。

其實，它被廣泛用於膠圖條帶的定量分析，如下圖這篇文章就是用Image J分析western-blot條帶灰度值（Band density）進行相對定量。

（Nature，2010）

下面就介紹下如何用ImageJ 進行條帶的灰度分析。

首先，通過FileOpen打開要分析的膠圖，如下圖。

接下來通過ImageType8-bit（如下圖）將圖片轉為為8位的灰度圖，即從黑到白有256（0~255）種灰色的黑白圖片。

接下來，將膠圖的灰色背景去掉，方法見下圖。

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然後用矩形選框工具框選一個條帶或泳道（先選最寬的），然後通過Analyze /gels / select first lane（快捷鍵ctrl+1）為泳道編號，移動編好的選區複製出新選區，接著通過Analyze / gels / select secondlane（快捷鍵ctrl+2）為其他泳道編號，方法見下圖。

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完成之後，通過analyze/ gels / plot lanes（快捷鍵 ctrl+3）（如下圖）繪製條帶的峰圖。

接下來只需用魔棒工具（Wand tool）點擊每個峰的中間區域即可逐一完成對峰面積的計算，計算的結果在Result 窗口顯示，可通過File 導出為xls文件。最後用目標蛋白的面積值除以內參蛋白的面積值，即可得到相對表達量，進而可繪製柱狀圖。

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如過把所有條帶選中，看作一個水平的泳道也可以分析（如下圖），不過計算峰面積時需要用直線工具鏈接峰的底部形成閉合的峰之後才能用魔棒工具獲取峰面積，也並不省時。

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