數據共享平台：Agora助力阿爾茨海默病治療靶標發現

圖片來源:Agora官網

AMP-AD是由隸屬於NIH的國家老齡化研究所（National Institute on Aging，NIA）牽頭，並由NIH基金會（FNIH）管理的競爭前公私合作項目，由政府、行業和非營利機構共同參與，旨在改善疾病治療靶標的發現和驗證方式。

AMP-AD計劃已從NIH信息庫中的3000多種人腦和血漿樣本中獲取了大量的基因組、RNA表達、蛋白質組學和代謝組學數據。專業研究人員可從AMP-AD知識門戶廣泛獲取原始數據和處理數據。AMP-AD聯盟成員已使用這些數據集發表數百篇研究論文。除AMP-AD研究人員外，外部研究人員也受益於數據共享政策，完成了重要成果，包括最近發表的一項研究，該研究突出了人類皰疹病毒與AD無關的結論。

雖然原始數據的使用通常僅限於具有生物信息學專業知識的研究人員，但AMP-AD研究人員做出了對更廣泛的研究人員適用的分析。Agora門戶網站首次提供AMP-AD聯盟成員之外的共享分析，能夠推動更多突破性的發現。

「Agora使研究人員能夠利用AMP-AD分析推進他們自己的科學問題，」Sage Bionetworks神經退行性疾病研究主任、Agora項目首席研究員Ben Logsdon說道，「這些分析雖然最初是為了AMP-AD研究人員，但現在它可以被廣泛應用。Agora提供了一個簡單的工具，可以讓任何人探索和利用這些結果。」

「Agora本次發行的版本中最令人興奮的內容是AMP-AD潛在靶標列表——一組經過大量人類多組學數據的無偏差計算分析得到的基因和蛋白質，」 NIA項目總監，Suzana Petanceska博士說道，「這些分子信號可以闡明新的疾病生物學或作為新的治療目標。我們在目標評估過程的早期有意釋放它們，以便我們整合外部研究資源集中評估。」

「因為AMP-AD開放運作的形式，研究人員會迅速公開數據和結果，同時，他們會接受早期同行評審，以幫助指導研究決策，」Sage Bionetworks總裁兼AMP-AD首席研究員Lara Mangravite說，「Agora擴展了這種方法，以便外部研究人員可以積极參与AMP-AD靶標的評估；並通過評估他們感興趣的基因對多種計算整合分析的表現，來進一步開展自己的研究。」

Lara Mangravite.來源:Sage Bionetworks官網

「AMP-AD是對國家抗阿爾茨海默病計劃的明確回應，」NIA神經科學部主任醫學博士Eliezer Masliah說。「它正在促進精準醫學，開放科學，並迅速傳播新的疾病靶標，為AD提供更多的研究靶標。」

Agora將經常更新，以納入AMP-AD及其附屬AD聯盟的最新分析。初始版本包括四個人類RNA序列數據集的差異表達和共表達網路整合分析。未來的版本將擴展到包括人類蛋白質組學和代謝組學分析、跨物種疾病特徵的比較評估，以及成藥性和可追溯性信息的整合，以指導早期藥物發現的靶標選擇。

關於Sage Bionetworks

圖片來源:Sage Bionetworks官網

Sage Bionetworks是一個非盈利的生物醫學研究組織，成立於2009年，旨在通過建立基於社區的科學調查和發現方法來促進生物醫學的創新。

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