蛋白質組學方法用於早期妊娠體腔液分析
本文由George編譯,瑪莉、江舜堯編輯。
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近期,Scientific Reports雜誌上發表了一篇來自義大利卡拉布里亞大學罕見病分子診斷實驗室科研團隊利用蛋白質組學做早期產前篩查的文章。在文章中,詳細說明了蛋白質的富集、定量的流程,並利用該方法找出任何影響胚胎和母體的生理/病理性的變化。同時,也發現了鑒定胎兒性別的蛋白質。
體腔液(Coelomic fluid)是妊娠囊最早產生的液體,在孕早期或最初的12周,體腔液都與胎盤直接接觸。同時,體腔液也常被用於早期基因篩查。研究團隊因此將諸如羊水的體腔液,用於產前篩查。
研究人員選取懷孕7-10周的婦女作為調查對象,收集到22份CF樣品。進一步純化獲得CF細胞和CF上清。細胞用於形態學及遺傳學分析,上清用於蛋白質組學分析。(文章詳細說明了蛋白質純化的方法)
「該研究的目的在於通過shotgun蛋白質組學的實驗流程,繪製體腔液蛋白質組差異表達的圖譜」,研究團隊說道。「iTRAQ-MARS在眾多測試過的方法中最為有效,鑒定和定量到了88個特有的胚胎蛋白質。」
一些體液樣品,比如血漿中存在的高峰度蛋白質,常常會影響蛋白質組學結果的準確性。使用MARS(Multiple Affinity Removal Spin)技術能夠去除樣品中的高丰度蛋白質,再與基於iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation) MS/MS技術聯合使用進行蛋白質的定量分析,能夠大為提高結果的準確度。最終,研究團隊鑒定到了一些可能與已知疾病通路相關的蛋白質。
「值得注意的是,文獻曾報道過的通過產婦血漿/血清或者羊水診斷到的特定疾病與我們iTRAQ-MARS技術所檢測、定量到一些蛋白質,切實相關。」研究團隊說道。
在定量到的蛋白中,染色體X蛋白質CXorf23常被用於胎兒性別鑒定。進一步通過熒光定量PCR分析CF細胞和胎兒組織,其結果與蛋白質組學數據100%一致。
除了鑒定性別,相關蛋白也可能在神經、呼吸系統、眼睛和頭部系統疾病的治療領域存在功能性聯合。


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