一種重要的大腦表觀遺傳修飾
埃默里大學的科學家詮釋了果蠅大腦發育過程中一種重要的DNA修飾。《Molecular Cell》報道了這項研究。
表觀遺傳學是一門「高於基因」的科學,在這個領域中「DNA甲基化」是研究的熱點。甲基化不能改變DNA密碼(A、T、C、G),但它卻能改變DNA被細胞處理的方式。通俗的說,它是關閉DNA的標籤。
DNA甲基化的最常見形式是出現在C(胞嘧啶)上。儘管果蠅是廣為人知的遺傳學模型,但其體內卻很少有這種形式的DNA甲基化,在果蠅中,更常見的是A甲基化(專業名稱是N6-甲基腺嘌呤,m6A)。然而,目前為止,人們還不知道它對果蠅來說代表了什麼。
遺傳學家Bing Yao博士和Peng Jin博士最近發現,一種消除A甲基化的酶對果蠅的神經元發育至關重要。
這種酶家族(TET)在哺乳動物中的作用是脫去C甲基化,2009年人們才發現原來是TET酶主動去除了DNA甲基化,而不是自然脫落。
從蛋白質的角度來看,甲基化就是DNA分子上支起的一個基團,引人注意的是,哺乳動物和果蠅的脫甲基化酶竟然是相關的。
去年,Yao副主任課題組在《Nature Communications》發文報道,面對壓力小鼠腦細胞基因組中m6A水平發生變化,另一個實驗室最近報道,儘管非常罕見,其實人類基因組中也具有腺嘌呤甲基化形式(頻率為2000個腺嘌呤中有1個),出現頻率在癌細胞中明顯減少。
果蠅的脫m6A酶名叫DMAD(DNA N6-甲基腺嘌呤脫甲基酶)。如果人為突變去除DMAD的編碼基因,果蠅在早期發育階段就會夭折。埃默里大學的研究人員創建了只關閉大腦DMAD基因的果蠅模型,這種人為干擾會導致關係到學習和記憶能力的蘑菇體發育障礙。
在果蠅中,m6A更為罕見(約百萬分之二十五),並且僅局限在基因組部分區域。去除DMAD意味著m6A丰度增加,並且,人工提純的DMAD蛋白也可以去除試管中DNA的m6A。
Jin說,這篇論文的一個重要發現是,抑制果蠅和人類基因轉錄的多梳蛋白很可能是m6A的潛在「讀者」。研究人員發現,m6A在多梳蛋白結合DNA區域更為常見,反過來,多梳蛋白液傾向於結合含有m6A的DNA。
原文標題
Active N6-Methyladenine Demethylation by DMAD Regulates Gene Expression by Coordinating with Polycomb Protein in Neurons
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