FFPE樣本也可高效做ChIP，獲得合適染色質片段僅需40min！

福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)臨床樣本是目前疾病分子層面及臨床研究的重要樣本庫來源。然而FFPE樣本本身也存在著核酸降解嚴重、脫蠟困難、抽提效率低的問題。ChIP技術是用於檢測DNA與蛋白質體內相互作用的經典方法，要得到一個好的ChIP結果也是要經過長時間的摸索，用FFPE樣本做ChIP可以說是一項巨大的挑戰。ChIP實驗難，用FFPE樣本做ChIP則是難上加難！

如果能建立一種高效簡便可重複的FFPE樣本做ChIP的實驗方法，那我們便能夠利用現有的FFPE樣本庫進行疾病表觀遺傳學變化的研究，為治療干預尋找新的靶點打下堅實基礎。近日Covaris新開發出了一個簡單、快速、重複性高、可規模化的利用FFPE樣本提取染色質後下游進行ChIP實驗的方案，使得這一設想成為現實！

這個整合創新的流程有多簡便呢？看下圖！左邊truChIP FFPE是Covaris 開發的新型流程，右邊FFT Protocol是傳統流程。truChIP FFPE僅需40min即可從FFPE樣本中得到正確剪切的染色質片段，而傳統流程需要120min！ 40min VS 120min省心省時，省力省的不止一點點！

圖.1 Covaris FFPE ChIP流程 VS 傳統流程操作和時間對比

truChIP FFPE

Covaris 藉助AFA聚焦超聲技術，結合其truXTRAC FFPE和truChIP染色質剪切試劑盒的優勢，將二者整合優化，成功建立了簡便高效的FFPE樣本ChIP實驗流程。

（看這裡，FFPE樣本核酸提取秘笈！）

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