數據分析全面升級∣微分基因抗生素抗性基因檢測再發力

近年來，抗生素抗性基因的研究逐漸成為環境微生物研究方面的一個熱點，在細菌耐藥方面，微分基因一直致力於抗生素抗性基因（ARGs）檢測產品的研發和服務，已與全國多家科研院所進行過合作。

如今，隨著生物信息學分析手段的不斷發展，抗生素抗性基因的分析方法也在逐漸增多，作為國內首家推出抗生素抗性基因檢測產品的公司，微分基因的抗生素抗性基因檢測服務也在不斷更新升級，數據分析的內容多樣化以及展現形式更加人性化，能更好的為您的科研助一臂之力。

生信分析，全面升級

1

抗生素抗性基因統計可視化

環境微生物中存在著數量眾多且非常多樣化的ARGs，通過Wafergen超高通量qPCR系統進行ARGs檢測，根據設定的Ct值閾值，針對qPCR檢出的抵抗不同抗生素的ARGs進行數量統計，以堆積圖和餅狀圖的形式展現。相對於表格數據展示，堆積圖和餅狀圖展示更直觀，美觀度也大大提升。另外還可以針對ARGs抵抗機制進行繪圖。

圖1-ARGs檢出堆積統計

圖2-ARGs檢出抵抗抗生素類別餅狀圖

2

增加ARGs丰度模式分析

利用不同基因在樣本中的相對基因拷貝數，通過繪製聚類熱圖，可以比較不同樣本中的ARGs丰度差異。樣本可以設置1個對照樣本，用實驗樣本與對照樣本比較繪圖，觀察實驗樣本的ARGs相對於對照樣本的ARGs的丰度關係。也可以無對照樣本，針對所有樣本進行繪圖，觀察不同樣本間的ARGs丰度差異。

通過觀察不同處理組（樣本）之間ARGs丰度差異，可以尋找到不同分組（樣本）或與對照樣本間主要差異ARGs，後續可以針對差異的ARGs進行深入分析。

圖3-ARGs丰度模式聚類熱圖（基因）

圖4-ARGs丰度模式聚類熱圖（抗生素）

3

增加抗生素抗性基因與樣本關聯性分析

Circos是一款功能強大的可視化軟體，多用於展示基因組數據比較。我們通過Circos直觀展示不同樣品中檢出的ARGs抵抗的抗生素種類。

圖5-ARGs與樣本關聯性Circos圖

優質服務，邀您共享

微分基因微生物ARGs檢測

Wafergen平台(qPCR法)

通量大周期短

單張晶元可進行5184個反應，樣本檢測合格後，10工作日內交付全部數據和分析結果（單次送樣≤3張晶元）。

ARGs種類多，形式靈活

標準服務包含285個ARGs+8個轉座酶基因+2個整合酶基因+1個16S rRNA基因作為內參，共296個基因。包括四環素、萬古黴素、氯黴素、磺胺類、大環內脂類、氨基糖苷類、β-內醯胺類和喹諾酮類等抗生素的抗性基因，轉運蛋白相關基因等。

另可提供個性化需求定製ARGs引物列表，根據客戶樣本數量，定製上機模式，最大化節約成本和樣本。

性價比高，結果更準確

相對於常規qPCR檢測價格更低，機械化全自動加樣，結果更準確。

圖6-Wafergen平台

宏基因組測序

樣本處理經驗豐富

土壤、泥沙、腸內容物、糞便、水體、空氣、乳製品……豐富的多類型樣本提取經驗

數據優質

目前，世界上最大通量二代測序儀Illumina Novaseq6000平台，通量可達6Tb/run，數據質量高：平均Q30為90%左右。（來自微分基因自建庫測序數據）

分析內容豐富

CARD資料庫注釋，採用多種分析，獲得更多分析結果

深度數據挖掘，拓展後續服務

專業生物信息學分析團隊，提供數據分析作圖服務。強大的實驗和測序平台可提供微生物基因組de novo、重測序、16S/18S/ITS、宏基因組、轉錄組測序等微生物一站式測序分析服務

圖7-Illumina Novaseq6000平台

數據升級後的抗生素抗性基因檢測是不是魅力更大了呢？如果您正在關注抗生素抗性基因，有任何問題，歡迎後台留言或與我們當地銷售聯繫！我們期待與您共同合作！

微分基因為國家大基因中心「基因檢測平台」運營方，專註於高通量測序技術，公司憑藉國際領先的高通量測序平台，依託獨具優勢的高通量基因測序和大數據挖掘技術，為各大高校、醫院、科研單位以及第三方健康管理服務平台，提供專業的基因檢測和數據分析解讀服務。2017年，微分基因在國家大基因中心建成2133平方米的潔凈分子生物實驗室，公司科研團隊匯聚了一批國內外優秀的基因組學實驗和生物信息分析研究人員。

科技服務部依託公司先進的自動化建庫儀、高通量測序儀等實驗設備，提供多種測序服務；憑藉強大的科研團隊，為高校、科研院所等研究單位提供領先的生物信息分析服務。主營業務包括DNA測序、RNA測序、表觀組學測序、單細胞測序、ICELL8單細胞表達譜測序、晶元服務、三代全長轉錄組測序等。

健康|醫療|基因|科普

微分基因科技服務

記得這是一個有溫度的公眾號

喜歡這篇文章嗎？立刻分享出去讓更多人知道吧！