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基因檢測防治結核病!國內首個結核菌全基因組資料庫分析平台上線

什麼樣的情況可以確定為結核病疫情發生?結核病患者發生了耐葯怎麼辦?如今,基因檢測在結核病防治中發揮著越來越重要的作用。

8月8日-10日,「結核病公共衛生事件病原同源性鑒定實用技術-基因型分析理論與實驗操作培訓班」在深圳舉行,結核菌全基因組資料庫分析平台SAM-TB也正式上線。該平台是國內首個結核菌全基因組資料庫及分析平台,集數據存儲、自動流程分析、耐葯預測、遺傳距離計算等功能於一體。

據悉,隨著全基因組測序和VNTR分子溯源技術在結核病防治中的深入應用,結核病公共衛生事件的應對水平和處置能力將得到提升。

結核病仍是危害人類健康的重大疾病,尤其是2017年底湖南桃江學校結核病公共衛生事件,引起了業內外人士的高度重視。開展結核病突發疫情的應急檢測,從基因水平鑒定不同感染者菌株之間的同源性,可以協助公共衛生工作者採取及時有效的防控措施,避免下一個類似桃江事件的結核病爆發。

中國防癆協會秘書長成詩明表示,如果出現結核病疫情,就需要啟動類似SARS爆發期間的疾病控制的應急機制。

那麼怎麼確定疫情是否爆發呢?深圳市慢病防治中心通過「三名工程」引進的復旦大學結核病防控策略和示範應用研究團隊帶頭人高謙教授表示,「同一穩定群體,比如學校,在半年內發現10例以上的結核病患者,通過基因分型應急監測,若結核菌基因型相同,則定義為結核病爆發,需要採取局部應急防控措施。」

結核菌基因水平的同源性分析,有助於判定結核菌傳播路徑。因為如果兩位患者體內的結核菌基因序列完全一樣或者基本一樣,那麼這兩位患者相互傳染的可能性就極大,否則兩者的疾病與相互之間的傳播並無關係。

隨著耐葯結核病的廣泛流行,結核菌的藥物敏感性實驗對結核患者的用藥選擇成為必要條件。然而結核菌的慢生長特性,常規耐葯檢測通常需要一個月以上才有結果,更重要的是很多藥物還沒有良好的耐葯檢測方法。而剛上線的結核菌全基因組資料庫分析平台,利用全基因組高通量測序數據,通過該平台的自動化軟體,可以快速全面獲得結核菌的耐葯信息,有利於臨床醫生及時選擇有效藥物對患者進行治療。

此外,利用全基因組分析或基因型分析,可以掌握不同患者之間的基因型或者全基因組信息,從而判定結核菌的傳播規律,為結核病預防控制提供切實有效的建議。

來源:基因谷


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