要研究細胞系,基因?你可能會對這個網站愛不釋手哦
細胞系是很多基礎研究的同學主要的研究的對象,也是體外實驗不可缺少的步驟,我們往往會想知道某個基因在某個細胞系的表達情況,為啥呢?
因為如果該細胞有某種表型B比如增殖能力強,和對照細胞相比,其A基因明顯高表達,那我們就有理由推測A基因和B表現可能有關。
有時候我們也要知道某個基因在某個細胞系的基礎表達量
.....
總之,了解某一個細胞系的基因表達量對科研方向和思路非常重要!
但是是不是要通過自己跑細胞的PCR來知道呢?
完全不需要,下面的網址就可以了!
https://portals.broadinstitute.org/ccle
CCLE是Broad研究所與諾華研究基金會聯合開發的在線資料庫,大家看到界面很簡潔,直接輸入你想查的Genes或者細胞系,就可以了。目前,該資料庫已經收錄1100多種細胞系的基因信息,並實現了可視化,包含拷貝數,mRNA表達(Affy),RPPA,RRBS和mRNA表達(RNAseq)...
可貴的是,CCLE仍然不端更新...
比如我在框里輸入COLEC12這個基因
如上,你可以選擇表達量數據,突變數據,染色體異位融合數據,甲基化數據。
上圖可以清楚的看到,COLEC12這個基因在各個細胞系的表達.
你可以嘗試你感興趣的2個基因,橫坐標和縱坐標分別代表2個基因,正負代表高低表達(有點像流式),你很快就能夠看出來在某個細胞系中兩者之間的表達量情況:同向增高?同向減少?一高一低?
在科研的哲學De課程里,我們講到過,生命體里的基因往往是協同或對抗完成某一個生物學功能的,那麼他們到底是協同還是對抗呢,因為每個基因他本身的一些功能是知道的,比如EGFR是表皮生長因子...
所以你就可以....
信息量巨大啊
當然,你也可以反過來查某一個細胞系裡的基因表達情況
最後,記住,所有搜索結果都是可以進行下載!
AliA來自UK,也是弗雷賽斯潤色編輯部的主編,具有6年的潤色服務經驗,深知中國式英語常犯的錯誤,他的講解會讓你恍然大悟,驚嘆道「SCI寫作」原來應該是這樣的。


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