PNAS：核小體或會抑制「基因魔剪」CRISPR-Cas9的切割效率

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近日，一項刊登在國際雜誌Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究報告中，來自猶他大學的科學家們通過研究發現，核小體會抑制CRISPR/Cas9的切割效率，文章中，研究人員描述了如何在酵母樣本中檢測相關的基因編輯技術以及他們的研究發現。

圖片來源： Janet Iwasa (University of Utah, Salt Lake City)

「基因魔剪」CRISPR/Cas9能夠利用導向RNA來尋找並且切割DNA片段，但當靶向片段是核小體的一部分會發生什麼呢？此前研究人員通過研究發現，在這種情況下，似乎CRISPR/Cas9的切割效率會被降低；這項研究中，研究人員通過對這種情況進行體內試驗發現，此前的研究結果是正確的，即利用CRISPR/Cas9切割核小體或許會降低其作用效率。

DNA鏈雖然很小，但如果其拉伸的話大概有六英尺長，正因為如此，細胞就擁有了如何將DNA包裝到細胞核中的特殊機制，這一機制包括將DNA鏈纏繞在特定的蛋白質上，而諸如捲成的束狀結構稱之為核小體，邏輯表明，編輯DNA鏈的技術可能會因為可獲取性的問題而遇到困難。其他研究人員也考慮到了這種問題的可能性，但他們在試管中研究過，或者在非核小體的已知鏈上做過相關的研究，這項研究中，研究人員就想通過研究來闡明CRISPR/Cas9在編輯核小體部分鏈上是否像編輯其它DNA鏈那麼有效。

文章中，研究人員利用CRISPR/Cas9技術對活酵母中不同的導向RNAs進行編輯，這就能夠實現對不同靶點的編輯。研究者表示，相比非核小體的區域而言，當對核小體區域進行編輯時，CRISPR/Cas9的編輯效率會發生降低；當研究人員對諸如鋅指等基因編輯技術進行監測時，他們並未發現任何差異，後期研究人員或將進行更為深入的研究來改善CRISPR/Cas9對核小體區域進行基因編輯的效率。

參考資料：

Robert M. Yarrington, Surbhi Verma, Shaina Schwartz, et al. Nucleosomes inhibit target cleavage by CRISPR-Cas9 in vivo, Proceedings of the National Academy of Sciences (2018). DOI:10.1073/pnas.1810062115

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