進化論也能作用於法庭？
艾滋病從20世紀末爆發後，帶來了廣泛的社會影響。有那麼一小撮喪心病狂的艾滋病患者出於種種原因決定報復社會，故意隱瞞自己的病情，並在不採取任何保護措施的情況下與多人發生性行為，把艾滋病傳染出去。
而艾滋病病毒跟近年受關注的伊博拉病毒不一樣，其潛伏期相對長，因此當你終於發現自己被感染了，想要回頭指證犯人的時候就會比較困難：犯人必然會狡辯說你是從其他地方感染的，而跟他沒關係。同時，艾滋病病毒繁殖得很快，短短24小時就可以複製出幾十億個子病毒。身為RNA病毒，他們的基因突變率非常高，因此，傳統的DNA比對方法（比如比較現場血跡和嫌疑人的DNA）在艾滋病上很難行的通：等到你發現自己感染了艾滋病的時候，你身上的病毒都不知道突變過多少次了，而犯人身上的病毒也在不斷突變，幾乎不可能把兩者匹配到一起。
艾滋病病毒三維模型
難道犯人會就此逍遙法外嗎？別急，在進化生物學家的眼裡，類似這樣的案例幾乎就是一個異地分化的過程：犯人身上攜帶的艾滋病病毒中有一部分感染了受害人，留在犯人身上的病毒和跑到受害人體內的病毒，各自在不同的環境中獨立進化，形成了二者之間的差異。有沒有一種似曾相識的感覺呢？這簡直就是人類進化史的縮影嘛！人類祖先有一部分走出了非洲，遷徙到了其他地方，留在非洲的人和遷徙出去的人，各自在不同的環境中獨立進化，形成了不同人群之間的差異，這不是咱的老本行嘛！既然能搞清楚人的進化史，這小小的艾滋病自然不在話下啦！
比如德州有一名男子被控故意傳染艾滋病給六名女性，於是，警方對這七人各自身上的艾滋病病毒進行了採樣，同時也採集了當地與此案無關的其他艾滋病病人的樣本，和資料庫中的艾滋病病毒的數據一起作為對照，分析其親緣關係（也就是一個迷你型的進化樹），結果如下：
其中，彩色標識的CC01-CC07是涉案的七個人（為了保證客觀性，實際操作的科學家只知道樣本編號，不知道具體來源），黑色的是來自當地和網路資料庫上的非涉案人員樣本，大紅點是最近的共同祖先。
結果表明，涉案的七個人身上的艾滋病病毒有最近的親緣關係，並且CC02~CC07的樣本都源自於CC01的不同分支，呈現並系群（paraphyly）的狀態。換句話說，CC01是感染源，他身上的病毒中有一小部分感染了CC06，一小部分感染了CC07，一小部分感染了CC05……以此類推，由於每次感染都只有一小部分病毒從CC01身上跑到其他人身上，所以從CC02至CC07的所有樣本的病毒才會簇居在CC01這個源頭分支之下，彼此之間都是獨立分支。
科學家由此提交報告指正CC01是傳染源，而庭審時，樣本身份揭曉，CC01正是被告，結合其他證據，犯人最後被判了45年，為受害者們主持了公道。
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