他因喬丹一句話無緣夢之隊，十年後一笑泯恩仇
說起夢之隊，球迷們第一時間想到的就是大佬雲集，實力超強的球隊；而夢一隊更是拔尖的存在，12名成員除了一名當時帶領NCAA奪取兩連冠的杜克大學雷特納，其餘十一名成員全是名人堂成員。當時主帥是壞孩子軍團底特律活塞隊的主教練查克戴利，那麼作為壞孩子軍團領袖的托馬斯也是當時炙手可熱的超級巨星，那可是巴塞羅那奧運會前兩年的總決賽MVP；為什麼沒有入選夢之隊呢？這要從他和喬丹的恩怨說起！
1984-85賽季是喬丹的菜鳥賽季，場均貢獻28.2分6.5籃板5.9助攻卻一點不像菜鳥，最終入選全明星陣容，托馬斯則是東部全明星後場首發陣容；比賽前關於喬丹和托馬斯有一段小插曲：那一天喬丹在電梯里碰到托馬斯時，一聲不吭；托馬斯認為自己在NBA里算得上是喬丹的長輩，喬丹沒打招呼，就是根本看不起自己；而喬丹後來在他的自傳中也提到過這件事，「當時電梯里有很多大牌球員，我不想表露得太過自信，所以我一句話沒說，」喬丹寫道。托馬斯確認為喬丹不夠尊重他，所以在比賽前就和部分全明星球員「串通」好了——盡量不給喬丹傳球！托馬斯甚至讓西部全明星陣容中的「冰人」喬治-格文多進攻喬丹這一點，讓他在場上難堪！喬丹這屆表現確實不是很好：9投2中，得到7分6籃板2助攻3搶斷。
喬丹在獲得總冠軍前的三個賽季都是在季後賽敗給了托馬斯的壞孩子軍團，而在1990-91賽季，喬丹的公牛隊則橫掃了活塞隊，在第四場比賽終場前7.9秒的時間，托馬斯和蘭比爾直接通過公牛隊的替補席離場揚長而去，這一舉動在NBA歷史上是很罕見的，不單單讓球迷看懵了，因為這是對於對手非常的不尊重。
在1992年的巴塞羅那奧運會，喬丹剛帶領公牛隊取得二連冠，被應招進入夢之隊的時候明確表示：有他（托馬斯）沒我。最終托馬斯沒能參加奧運會也成為了自己的遺憾。而後來魔術師約翰遜的自傳中承認當時沒人願意跟托馬斯成為隊友：「其實，這是伊賽亞自作孽的結果，因為沒有人願意和他一起打球，」魔術師約翰遜說，「喬丹自然是不希望和他同隊，斯科蒂-皮蓬也不願意，馬龍不願意和他一起，伯德也沒有站出來給他說話。有人站出來說，『我們需要這個傢伙』？沒，沒有人這麼說。」
2003全明星，是喬丹最後一屆全明星賽，當屆票王卡特主動讓出了首發的位置，而作為東部教練的以賽亞托馬斯也讓喬丹在比賽中留了足夠的時間展示自己，賽後兩人擁抱一笑泯恩仇。
