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將測序150萬物種,地球生物基因組計劃啟動

將測序150萬物種,地球生物基因組計劃啟動

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鴨嘴獸是為數不多的基因組已經被測序的複雜生物之一。圖片來源:Dave Watts

本報訊11月1日,一項對全球所有複雜生物體基因組進行測序的雄心勃勃的計劃在英國倫敦正式啟動。

「基因變異是所有遺傳學知識的源泉。」項目成員之一、澳大利亞墨爾本拉籌伯大學進化遺傳學家Jenny Graves說,「你擁有的基因變異越多就越好——那麼為什麼不對所有的事物展開測序呢?」

這項地球生物基因組計劃的目標便是在未來10年內對全世界約150萬種已知的動物、植物、原生動物和真菌物種(統稱為真核生物)的基因組進行測序。這項倡議估計耗資47億美元,到目前為止只籌划到其中的一小部分資金。

作為這項計劃的一部分,來自茵格斯頓市惠康桑格研究所的科學家宣布,他們計劃在未來8年的時間裡花費5000萬歐元(6500萬美元)對英國的真核生物基因組進行測序,其數量約為66000種。

對惠康桑格研究所的支持——將來自該所的總體預算——是迄今為止對這項努力最大的承諾之一。

據美國加利福尼亞大學戴維斯分校進化生物學家、地球生物基因組計劃工作組主席Harris Lewin估計,關於該項目迄今為止所作的財政承諾總計約2億美元。這是該項目為期3年的「第一階段」的預估成本的1/3。這一階段打算對9000類已知的真核生物中的每一類的至少1個物種的基因組進行測序。他希望在1年內籌集到剩餘的資金。

地球生物基因組計劃包括十多個現有的測序項目。例如生命之樹的特定分支,如鳥類、昆蟲和植物;或者對於一個特定國家的生物多樣性的研究,如在英國被正式稱為達爾文生命之樹的項目。

Lewin表示:「我們不需要一個基因組計劃來控制所有的項目。」相反,他說,這項努力存在的理由便是為了確保正在進行的生物多樣性測序工作的標準化。

「當你接近不同的科學團體後,會發現那是處於混亂和無政府狀態的。」Lewin說,「如果到最後,每個人都在做自己的事情,那得到的就是巴別塔了。」

在此次倫敦召開的會議上,與會者討論了樣本採集、測序、數據管理和共享的指導方針。Lewin認為,制定這樣的標準對於使基因組對所有的科學家都有用——而不僅僅是對某一特定領域的科學家有用,是至關重要的。

參與這項工作的科學家說,因為地球生物基因組計劃是一個傘形組織,它對於確保測序工作能夠覆蓋所有生命科學分支也很有價值,而不僅僅是那些之前吸引科學家關注的領域。(趙熙熙)

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