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難怪阿爾茨海默病難治!科學家發現數千種App基因變體


  來源:奇點網


  不得不說活得長就是好,活得久了什麼都能見到,大腦這個人體最複雜的器官一次又一次刷新我們的認知,誰能想到呢,神經元竟然比其他體細胞都「技高一籌」,竟然還會只有免疫細胞才會的基因重組!


  本周《自然》雜誌刊登了一篇來自Sanford Burnham Prebys醫學發現研究所(SBP)的最新科研成果[1],研究者們終於確定大腦神經元存在基因重組現象,特別是研究所關注的與阿爾茨海默病(AD)有關的澱粉樣蛋白前體蛋白(App)基因,竟然能夠產生數千種變體!

  一方面,這個新發現說明屢戰屢敗的β澱粉樣蛋白理論或許並未走錯;另一方面,App的基因重組與逆轉錄機制有關,結合HIV感染者幾乎不得AD的現實,或許逆轉錄酶抑製劑是AD的一個可能的新療法!


  就算不談對疾病的意義,光是發現神經元也會基因重組這個事情就夠神奇的了,難怪有科學家評論這項研究是「近年來分子生物學領域最大的發現之一」、「里程碑式的研究」。


通訊作者Jerold Chun

通訊作者Jerold Chun

  以前我們寫到光遺傳學的時候曾經為大家介紹過,人的大腦是一個十分複雜的器官,神經元之間異質性非常高,高到兩個相鄰的神經元甚至可能具有完全不同的功能。是什麼讓神經元有了「七十二變」的能力呢?科學家最初給出的猜測就是,基因重組[2]。


  想必大家了解的基因重組發生在生殖細胞中,其實體細胞也會這個絕技,比如說免疫細胞,準確來說就是產生抗體的B細胞[3],為了高效生產抗體,它編碼抗體可變區的基因就可以通過重組形成新的DNA分子。


  那神經元到底會不會這個技能呢?科學家們雖然發現了神經元中的基因鑲嵌現象,也確定了不少重組模式,但是從沒有在特定的基因上證實重組的存在[4]。


  於是這次研究者們就把目光放在了App基因上,這個基因表達的澱粉樣蛋白前體蛋白經過分泌酶水解,產生的就是具有神經毒性的β澱粉樣蛋白肽和蛋白沉澱,也就是阿爾茨海默病的病理因素之一[5]。散發性阿爾茨海默病(SAD)患者和唐氏綜合症患者都存在APP拷貝數增加的問題,可見App基因應該對病理進展有作用[6]。


App基因在21號染色體上,它的拷貝數也和唐氏綜合症有關

App基因在21號染色體上,它的拷貝數也和唐氏綜合症有關


  當分析來自AD患者大腦的神經元時,研究者檢測到了完整的App基因,也檢測到了幾個已知與疾病有關的變體,不過奇怪的時,他們發現了更多的預料之外的變體基因。


  這些基因和以前報道過的變體都不同,很多都表現出中部外顯子丟失,兩端外顯子連接在一起,其中很常見的一類是3號外顯子和16號外顯子的連接(R3/16)。研究者把這些變體叫做gencDNA。


  但是這似乎是App特有的現象,另外一種與AD有關的基因早老蛋白1(PSEN1)就沒有發現這樣的變體。


App的各種gencDNA

App的各種gencDNA


  對比AD患者和健康人的神經元,差別很驚人。來自5名AD患者的96424個神經元中,共檢測到了6299種獨特的App序列,包括45種外顯子連接;同樣來自5名健康人的162248個神經元中,則只發現了1084種獨特的App序列,只有20種外顯子連接。


  來自AD患者的gencDNA不單單是數量上有近六倍的碾壓,其中還有11種已經被證實與AD的家族性發病有關了!而這些變化在非神經元細胞中是不存在的。


  研究者把部分gencDNA的表達產物拿到體外與細胞培養,證實了某些gencDNA產物是有生物毒性的。

  研究者還在AD小鼠模型中進行了檢測,發現隨著年齡的增長,小鼠腦中也出現了越來越多的gencDNA,同樣,在非神經元細胞中也不存在這樣的變化。


無論數量還是種類,AD患者的APP gencDNA都遠超正常人

無論數量還是種類,AD患者的APP gencDNA都遠超正常人


  那這些gencDNA是怎麼來的呢?


  看看這些gencDNA的長相,缺內含子,還有細胞特異性的亞型,感覺很像經過剪接的RNA。研究者猜測,說不準這些gencDNA就是從RNA來的,經過逆轉錄才成了今天的樣子!


  經過實驗,研究者確定了兩個gencDNA產生的必要條件:一是內源性逆轉錄酶的活性,二是過氧化氫導致的DNA鏈斷裂。考慮到逆轉錄過程實際上很「粗糙」,研究者認為這導致了更多不同的基因變異。



  那麼這或許就能夠解釋為什麼這麼多年來針對β澱粉樣蛋白的臨床試驗屢屢失敗了。通訊作者Jerold Chun做了個很妙的比喻,如果把DNA看作是一種語言,那麼App基因就是一個單詞,現在科學家發現一個單詞可以產生數千個我們從來都不認識的單詞——那麼原本針對某種單一蛋白的治療方法不起效也就不足為奇了。


  這應該是件好事,至少這麼多年來朝向β澱粉樣蛋白所作的努力並不是完全白費的。


  另一方面,逆轉錄酶作用的發現意味著目前已被FDA批准的抗逆轉錄病毒療法或許可以用於治療AD。流行病學數據也給了這個觀點有力的支持,HIV感染者極少患AD——事實上首個共病病例2016年才出現[7]。


  Chun認為,在當前對AD束手無策的情況下,考慮到HIV藥物普遍很安全,儘早開始相關的臨床研究也未嘗不可[8]。



  《自然》同期配發的評論對這個觀點倒是比較謹慎,認為在進一步確定App gencDNA產生機制和與AD的關係之前,談治療還為時尚早[9]。


  《科學》雜誌評論對這項研究給了很高的讚譽,多名科學家認為這是「多年來分子生物學領域最大的發現之一」,「是一項具有里程碑意義的研究」[10]。


  神經元細胞的基因重組可能不僅限於App基因,既然健康神經元也存在重組,那麼這很可能是一種神經元保持多樣性的獨特方式,以便提供更加豐富的大腦功能;未來更多的研究或許也可以延伸到帕金森等更多的腦部疾病。


  突然感覺我的腦子這麼厲害,我卻如此平庸……腦子我對不起你TAT


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