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用AI探索新葯研發,「默克杯」逆合成反應預測大賽啟動

疾病是人類永恆的困擾,全球眾多卓越的科學家投身於生命科學研究,用前沿技術為數以百萬計的生命帶來健康。與此同時,世界也在醞釀著新的產業革命,人工智慧( AI )正在變革與重塑生命科學領域,其必然會被寫入藥物研發的編年史,我們將有幸見證這一革命性時代的來臨。

人工智慧的加入能夠大幅簡化新葯的發現過程,逆合成分析就是很常用的一種手段。它對於新葯研發十分有意義,新葯承載的是無數人的生命。

廣泛應用的抗癌藥物——紫杉醇便能通過逆合成得到。原本 30t 天然紅豆杉干樹皮只能提取100g 紫杉醇,僅僅14年後,就有科學家用逆合成的方法,以樟腦為起始原料,合成紫杉醇,成本大大降低。

這次,我們把海量的化學反應方程式交給計算機去學習,讓計算機進行逆合成反應預測。

由默克主辦,和鯨科技(前身「科賽」)協辦的2019 「默克」杯 逆合成反應預測大賽將於1月21日正式開賽。

賽題介紹

本次大賽所用數據包含 150 W 的有機化學反應,參賽選手需要根據這些反應建模,最終通過給定的目標產物預測反應物。該數據集由英國劍橋大學博士 Daniel M. Lowe 收集整理,已公開在 figshare 平台。

傳統化學研究中,化學家們完成這一步耗時耗力:他們需要先從目標產物的分子式開始分析,再通過 Scifinder 搜索相似的結構和文獻報道過的合成路徑,確認需要哪些試劑、怎樣的反應序列,甚至要依據直覺制定幾十個化學反應,通過這些反應逐步生成目標產物,才能開始實驗。這個過程往往會需要一定的時間。對於新葯研發而言,效率是取得成功的關鍵。

得益於有機化合物及生物醫學的發展,經年積累的相關數據量也顯著增加,如何利用這些數據服務於藥物發現,是關鍵。

近年來,AI 技術不斷應用於化學和製藥領域,主要用於預測反應物。這次我們反過來,用反應物預測生成物,不僅複雜程度和挑戰性大大提高了,而且對於相關科學研究來說,意義重大。在未來,AI將成為科學家的定製工具,對於提高藥物研發的速度和效率、降低成本等,都有著巨大的益處。

大賽日程

初賽:1.21-3.1

選手進入和鯨科技官網報名,並在規定時間內提交 Notebook 方案。

初賽初篩(海選):3.4-3.15

由和鯨科技的專家團隊篩選出 50 支隊伍進入第二輪篩選。

二次篩選(複賽)

3.18-3.29默克專家對選手 Notebook 和建模思路進行評審,選出 6 支隊伍晉級決賽。

決賽:4月上旬

經過項目答辯,由大賽組委會評出最終獲獎名單,頒發榮譽證書和獎金。

大賽獎項

除以上獎項外,優秀選手和團隊還將獲得參觀默克的生命科學實驗室和參加默克的Workshop的機會,與專家面對面溝通交流!

成長型比賽

我們通常通過比賽來檢驗自己的能力,但這場比賽不止於此,它更是一種幫助參賽者成長的比賽。從比賽到訓練營的各環節,都配備了成熟機制與各項福利幫助參賽者成長。

大賽中會邀請化學領域專業人士對大賽相關化學知識進行直播講解,除此之外,大賽還配有免費訓練營。

免費訓練營:

如果擔心數據科學能力不足,我們有一個直通大賽的機器學習訓練。同時,沒有化學背景也不用擔心,訓練營會幫助大家普及與賽題相關的化學知識。

訓練營免費開放給所有參賽者!訓練營營員將獲得:

訓練營畢業證書

優秀學員證書

主辦方實習機會

有機會參加默克 Workshop

大賽與訓練營相對獨立,如果你對自己的能力有信心,可以直接報名比賽;如果你看中訓練營的成長性,也可以只參加訓練營。當然,也非常歡迎你兩個一起參加,訓練營學習完就進入比賽實戰。

你的能力對於比賽至關重要,你的成長對於未來更關鍵。

友情提示:訓練營相關事宜,請關注科賽公眾號近期消息。

如何報名

關於默克生命科學

作為世界一流的合作夥伴,默克為全球生命科學用戶提供高質量的產品組合和創新能力,擁有行業領先的電商平台: SigmaAldrich.com ,致力於推動科學研究,提高藥物研發和生物製藥生產的質量和效率,並為獲取準確可靠的診斷和檢測結果提供安全的保障。我們的願景是使全球各地的人們能夠更快地獲得提升人類健康水平的解決方案。我們的產品被廣泛應用於國內高校、科研單位、研究所、食品藥品質量監督管理機構、食品藥品生產廠家、醫療機構、生物科技企業、工業等諸多領域,助其解決業內的挑戰和難題。

關於默克

默克是一家全球領先的科技公司,專註於醫藥健康、生命科學及高性能材料三大領域。全球約有51000名員工服務於默克,他們致力於推動技術進步,改善人們的生活,從應對癌症和多發性硬化症的生物療法、應用於科學研究和生產的尖端系統,到智能手機和平板電視的液晶材料。2017年,默克在66個國家的總銷售額達153億歐元。

默克創建於1668年,是世界上歷史最悠久的醫藥化工企業。默克家族作為公司的創始者至今仍持有默克大部分的股份。位於達姆施塔特的默克在全球擁有「默克」這一名稱和品牌的所有權。僅有的例外是在加拿大和美國,默克在這兩個國家使用的名稱是EMD Serono,MilliporeSigma和EMD Performance Materials。默克在中國已經有85年發展歷史,目前有 3500 名員工,在北京、上海、香港、無錫、蘇州和南通有20個註冊公司。

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