Am J Rhinol Allergy:MIR-17-5P在季節過敏性鼻炎病理中的作用研究
導語:CPEB4和CREB也許在SAR病理中是有作用的。另外,MIR-17-5P通過靶向ABCA1和CD69在SAR中也具有作用。
來源:梅斯醫學
作為最流行的鼻炎類型,過敏性鼻炎包括了季節過敏性鼻炎(SAR)和永久過敏性鼻炎。最近,有研究人員嘗試闡釋SAR的機制。
研究人員從基因表達綜合資料庫中提取了基因晶元數據集GSE43523(包括了7個SAR鼻上皮細胞和5個非過敏性對照鼻上皮細胞)數據。基於limma包,研究人員對2個組進行差異表達分析來獲得差異表達的基因(DEGs)。另外,研究人員對DEGs基因的功能進行了富集分析。結合Cytoscape軟體,研究人員對蛋白互作(PPI)網路進行了構建,並獲得了一個顯著的網路模塊。研究人員還對轉錄因子靶標和miRNA靶標對進行了預測。研究發現,鼻炎和對照群體之間具有274個DEGs,包括了144個上調的基因和130個下調的基因。在建立了DEGs的PPI後,研究人員鑒定了一個顯著的網路模塊。在TF-miRNA靶標調控網路中,ABCA1, CPEB4, CD69, MIR-17-5P和CREB程度更高。更多的是,ABCA1和CD69在調控網路中均是MIR-17-5P的靶標。
最後,研究人員指出,CPEB4和CREB也許在SAR病理中是有作用的。另外,MIR-17-5P通過靶向ABCA1和CD69在SAR中也具有作用。
原始出處:
Liu X, Ren Y, Sun X et al. Bioinformatics-Based Approaches Predict That MIR-17-5P Functions in the Pathogenesis of Seasonal Allergic Rhinitis Through Regulating ABCA1 and CD69. Am J Rhinol Allergy. 8 Jan 2019.
本文系梅斯醫學(MedSci)原創編譯整理,轉載需授權!
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