研究發現影響組織炎症癌症轉變及免疫治療響應的免疫細胞和分泌因子

2月12日，國際學術期刊Cell Reports（《細胞通訊》）在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所隸屬的計算生物學研究所（中國科學院-馬普學會計算生物學夥伴研究所）韓敬東研究組的論文「Immune cell types and secreted factors contributing tissue inflammation-to-cancer transition and immune therapy response」。該研究基於多組織的癌症基因組學數據構建計算方法，挖掘多個組織中炎症-癌症轉變的共同基因模塊和影響該過程的關鍵免疫細胞及相關分泌因子，為癌症早期檢測提供了潛在的生物標記物。

儘管人們已知慢性炎症增加多種癌症的風險，然而炎症如何促進癌症發展仍然沒有明確。其中，判斷炎症組織何時向癌症轉變至關重要。為實現無偏檢測免疫細胞及其分泌因子影響炎症-癌症轉變的分子機制，該課題研究人員開發了計算方法「SwitchDetector」。分別基於肝癌、胃癌和結腸癌的轉錄組數據，識別出血管生成作為多種癌症的炎症-癌症轉變的共同關鍵事件；並利用浸潤免疫細胞類型的組成情況，以及其分泌或抑制的胞外因子來預測該關鍵事件的基因表達。這些識別出的胞外因子可作為潛在的癌症前、癌症早期檢測的生物標記物，並且可以與血管生成基因一起實現癌症預後和病人免疫治療響應的準確預測。SwitchDetector軟體以及炎症-癌症（inflammation-to-cancer，I2C）資料庫在www.inflammation2cancer.org公開發布，可供下載和查詢。

炎症-癌症轉變事件檢測的流程概念圖

來源：上海營養與健康研究院所

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