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亮點文章

桃育種史

Yong Li, Ke Caoet.al.

Genome Biology201920:36

來自中國農業科學院鄭州水果研究所的研究者對480份野生和栽培品種的桃進行了綜合分析，研究發現它們在馴化和改良方面具有明顯的階段性。

cellfishing.jl：一種用於單細胞RNA測序的超快速可擴展細胞搜索方法

Kenta Satoet.al.

Genome Biology201920:31

最近單細胞RNA測序（scrna-seq）技術的進步使得轉錄子的大規模平行分析成為可能，從而促進了涵蓋多種多細胞生物的大規模研究。在此背景下，來自東京大學的KentaSato提出了一種新方法：CellFishing.jl，用於搜索類似細胞的圖譜數據集，能以高精度和高吞吐量檢測來查詢細胞中重要的基因。

擬南芥親本表達基因的預測與鑒定

Jordi Moreno-Romeroet.al.

Genome Biology201920:41

Moreno-Romero和他的同事們發現，擬南芥中父系表達的基因比以前發現的要多得多，並顯示出對基因組印記相關途徑的洞察。

BAP1單倍體不足預示著一種獨特的免疫原類型的惡性腹膜間皮瘤

Raunak Shrestha, Noushin Nabaviet.al.

Genome Medicine201911:8

惡性腹膜間皮瘤（PEM）是一種罕見的致命癌症，起源於腹部的腹膜內側。PEM的標準治療僅限於細胞減少性手術或化療，而且沒有有效的針對性治療。一些間皮瘤的免疫檢查點抑製劑的存在與該腫瘤的預後較差有關。本研究發現，對於對這種罕見癌症類型的免疫檢查點抑製劑有反應的患者，BAP1缺失可能是一種有用的生物標誌物。

新生和遺傳的TCF20變異與智力殘疾、畸形特徵、低血壓和神經損傷有關，且與Smith-Magenis綜合征相似

Francesco Vetrini, Shane McKeeet.al.

Genome Medicine201911:12

使用外顯子組測序和染色體微陣列的臨床基因組測試有助於進一步定義潛在的新型綜合征性疾病。

其他文章

Impact of the gut microbiome on the genome and epigenome of colon epithelial cells: contributions to colorectal cancer development

腸道微生物群對結腸上皮細胞基因組和表觀基因組的影響：對結直腸癌發展的貢獻

Jawara Allen and Cynthia L. Sears

Genome Medicine201911:11

Predispositional genome sequencing in healthy adults: design, participant characteristics, and early outcomes of the PeopleSeq Consortium

健康成人的易感基因組測序：PeopleSeq的設計，參與者特徵和早期結果

Emilie S. Zolticket al.

Genome Medicine201911:10

Fragile DNA contributes to repeated evolution

脆弱的DNA有助於重複進化

Claudius F. Kratochwil and Axel Meyer

Genome Biology201920:39

A comparative evaluation of hybrid error correction methods for error-prone long reads

對容易出錯的長讀取片段的混合糾錯方法的比較評估

Shuhua Fuet.al.

Genome Biology201920:26

Structural rearrangements generate cell-specific, gene-independent CRISPR-Cas9 loss of fitness effects

結構重排產生細胞特異性、與基因無關的CRISPR-Cas9的失配效應

Emanuel Gon?alveset.al.

Genome Biology201920:27

Modeling double strand break susceptibility to interrogate structural variation in cancer

模擬雙鏈斷裂敏感性對癌症的結構變異影響

Tracy J. Ballingeret.al.

Genome Biology201920:28

Combined single-cell profiling of expression and DNA methylation reveals splicing regulation and heterogeneity

單細胞表達譜和DNA甲基化相結合分析剪接調控的機制和異質性

Stephanie M. Linkeret.al.

Genome Biology201920:30

Rapid turnover of life-cycle-related genes in the brown algae

褐藻生命周期相關基因的快速轉化

Agnieszka P. Lipinskaet.al.

Genome Biology201920:35

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