掌上測序儀公司Oxford Nanopore 登榜2019《麻省理工科技評論》50家聰明公司
在《麻省理工科技評論》中文版正式揭曉的2019年「50家聰明的公司」(TR50)榜單中,中國企業華為、騰訊和百度均列在榜單中。在生物科技公司中,研發掌上測序儀MinION的英國公司Oxford Nanopore Technologies因其顛覆式的實時DNA/RNA納米孔測序技術而被選中上榜。納米孔測序基於電子學原理,該技術的規模能夠從微型擴展到大型高通量設備,因此能夠帶來新的用戶,打開新的應用。Oxford Nanopore的目標是能使任何人在任何地點進行遺傳學分析。
圖片來源:MIT科技評論
「我們對Oxford Nanopore在中國被評選為50家聰明公司之一感到非常高興」,首席執行官Gordon Sanghera博士表示,「我們認為這項認可真正應該歸屬於納米孔社區,屬於那些開發了新的應用的納米孔測序用戶,無論是大規模人類基因組學、臨床研究和癌症研究,還是液體活檢方法、轉錄組學和植物科學等等,納米孔測序用戶正在進行的是真正『聰明』的研究。我們感謝納米孔社區每一個人的支持,也希望在我們共同邁向的令人興奮的未來中向你們報以持續不斷的支持。
「作為世界領先的出版物,傳統上《麻省理工科技評論》發布的50家公司名單突出的是那些「將真正的創新技術與成功有效的商業模式相結合」的公司。榜單同時專註於具有重大突破、對世界具有積極的社會影響,並且具有社會責任感的公司。
Oxford Nanopore於2018年正式進入中國市場,為中國的用戶提供納米孔測序技術。公司已經建立了本地的技術支持和銷售團隊,並為不同需求開通直接購買和代理商購買渠道。納米孔測序的應用已經在中國產生了一系列積極影響,例子包括在北京的食品產業中使用的食品安全方法,在香港的污水中進行耐葯基因標誌物的監測,北京希望組開展的人群規模測序探索對疾病相關遺傳變異的見解,南方科技大學在海拔4000米的祁連山進行凍土微生物群調研以理解氣候環境變化,協助中國疾控中心與獅子山合作援助衛生系統進行的疫情監測等等。
Richard Compton
客戶運營副總裁康睿馳(Richard Compton)本周在中國接受了《麻省理工科技評論》50家聰明公司的提名。
1. 過去1年(2018年~2019年Q1)公司技術/科技應用上最大創新進展或突破或成就為何?此處所指的進展、突破、成就足以影響公司價值或未來發展方向的重要里程碑。
我們的目標是使任何人在任何地方都能夠對任何生物進行分析,獲得有意義的信息。正因為我們的目標是顛覆測序技術的可用性,我們提供了一系列適用於任何需求的產品,不論是從大規模的人口項目測序,還是小型的按需和快速測試;無論是在實驗室,還是在現場。為打破DNA測序中的障礙,我們專註於產品的易用性,提供簡單快速的樣本製備解決方案。
在2019年,我們推出了最大規格的納米孔測序設備PromethION P24-48。它在提供Tb級別基因組數據的同時,無需付出對設備本身的資本投入。這意味著我們能夠為所有核心實驗室和服務提供商、需要對人類或植物等較大基因組進行測序的研究人員、以及人口規模的測序項目提供適合的選項,使低成本的大型納米孔基因組可能並且可得。
使用相同的核心納米孔技術,我們推出了MinION Mk1C——它是一個一體化的攜帶型聯網設備,將MinION的實時、快速、攜帶型測序與強大的用於數據處理的GPU相結合,配以高解析度的屏幕。它可與Flongle一起使用,Flongle是一種緊湊型、適用於小型按需測試的設備,支持在任何環境中以低成本快速獲得深刻的生物學見解。MinION Mk1C和Flongle開闢了在廣泛的地點開展一系列應用的可能性,從科學實驗室到農場和工廠,從醫療環境到戶外,或是在課堂中。
除了能夠提供覆蓋廣泛的基因組,以及高價值的基因組組裝來探究那些「隱藏的」疾病相關基因外,我們還針對那些測序準確度起到關鍵因素的研究開發了一種新型納米孔——R10。通過結合軟體演算法和化學試劑的持續改進,來實現將納米孔序列數據提高到最高的準確度。
我們希望研究人員能夠更輕鬆地在任何地點進行實驗,作為這個過程的一部分,在2018年,我們發布了包括VolTRAX在內的配件。VolTRAX是一種可實現快速樣品製備的小型自動化設備,我們也發布了可配備MinION / Flongle使用、僅有口袋大小的強大分析配件MinIT。
在2019年初,我們發布了「野外測序試劑盒」,它無需冷鏈運輸,只需十分鐘即可完成簡單的準備工作。這些能夠讓遺傳分析得以在偏遠的地區進行,使測序技術能夠在專業的實驗室環境之外使用。目前,中國疾控中心的專家正在獅子山支持其衛生部提升傳染病監測與防控的能力。利用MinION和野外測序試劑盒,在條件有限的情況下,在獅子山本土實驗室獲得了第一個重要腸道致病菌——傷寒的完整基因組序列。
2. 以當前公司所在產業/領域/技術方向/應用市場,公司過去1年所取得的里程碑突破/進展對總體環境(產業/領域/技術方向/應用市場)造成了什麼樣的影響?或者具有什麼樣的重要性?
從2018年到今年目前為止,納米孔社區已經湧現出了許多突破性科學的例子,涉及一系列生物學研究應用。這些包括大規模人類基因組學、癌症研究和液體活檢方法、理解人類生物學的轉錄組研究、環境研究,以及超越這些以外的在食品安全、農業、疾病爆發監測領域的應用。
2019年5月,中國領先的基因組測序服務提供商北京希望組(GrandOmics)宣布推出大規模人類基因組計劃dbSV100k。該項目將於2021年底提供10萬個高質量、且價格合理的人類基因組。該目標基於他們在短時間內通過納米孔PromethION系統所獲得的大量數據,項目旨在了解與人類健康和疾病相關的遺傳變異的影響,以期最終提供臨床基因診斷服務。另一家測序服務提供商諾禾致源(Novogene)也宣布利用Oxford Nanopore的測序技術啟動「癌症基因組計劃」,研究相關的疾病遺傳變異,為其客戶提供具有成本效益的基因組見解。
納米孔測序已經被整合到食品供應鏈中來快速了解病原體是否存在。Clear Labs(美國)開發了一種全機械自動化的「樣品到答案」解決方案,可以在24小時內進行高通量的病原體檢測。這使行業能夠儘早採取行動進行精確干預,獲得更好的結果,避免對消費者造成傷害甚至對行業造成干擾。在中國,Mars(瑪氏)全球食品安全中心最近提出了使用Oxford Nanopore對食品供應鏈進行實時監控的可行性方法,在一天內完成對沙門氏菌血清型的預測。
Oxford Nanopore提供唯一的攜帶型DNA測序技術,因此具有接近樣品源使用的獨特定位。這對於公共衛生疾病爆發、或著需要非集中的分散式答案的其它應用來說是非常理想的。
2018年,公共衛生小組將MinION部署用於對疾病暴發進行實時的基因組監測,包括狂犬病、拉薩熱、黃熱病、流感、登革熱、瘧疾、大腸桿菌、多重抗藥金黃色葡萄球菌(MRSA)等。例如,根據從野外實時MinION測序中獲得的基因組信息和見解,一個研究小組發現在奈及利亞發生的意外激增的拉薩瑟感染數量是源於一種已有的毒株而非新的變異,該結果被用於告知公眾健康部門進行應對。Flongle和MinION Mk1C的發布將進一步增強科學家獲得快速、有意義的遺傳信息的能力,不僅是在實驗室環境中,還有在醫療衛生、農業、食品和水監測和教育領域。
專註於易用性,MinIT和MinION已經使得研究人員能夠在坦尚尼亞的一個小農場中鑒定影響木薯植物的病原體,從準備樣品到獲得答案僅用三小時。這對於能夠摧毀全球8億人所依賴的作物的病毒爆發非常重要,它為科學家和農民提供了對抗植物病原體來提高作物生產力的基本信息。
研究人員還使用MinIT攜帶型分析儀在白令海上的阿拉斯加海洋研究船上,在8級風暴中分析了海洋微生物組。對於尋求了解海洋生物多樣性以及氣候變化如何影響海洋中的微生物的環境科學家來說,獲得實時的深入見解十分有用。
3. 根據麻省理工科技評論DeepTech對 「新興科技」的定義:未來3到5年內可大規模商用化的科學與技術,貴公司如何看待未來中國新興科技發展與趨勢?
作為一家總部位於英國的公司, 我們對中國在技術創新和技術採用新浪潮中所扮演的角色感到特別興奮。憑藉快速的發展、訓練有素的技能,以及快速接納新技術的文化,我們相信中國市場可以超越傳統技術,並且為消費者、醫療衛生專業人士和工業人士帶來實質性的益處。我們很高興與中國的同事合作,為社會多個方面帶來長期而積極的影響。
往期精選
圍觀
冷泉港發現CA19-9才是胰腺癌的「幕後玩家」
熱文
優秀運動員的微生物群中發現提高成績的菌
熱文
抗膽鹼能藥物可能導致阿爾茲海默症的到來
熱文
「頭頂大事」!防治男性女性脫髮新方法
熱文
還在當「夜貓子」?或許乳腺癌正在逼近你
End


※速覽 | 母雞日光浴,增加雞蛋維生素D
※一網打盡免疫組化(IHC)「疑難雜症」
TAG:生物探索 |