速覽 | 腸道病毒crAssphage解鎖旅行打卡新技能

旅行可以開拓眼界，也可以改變腸道結構。

聖地亞哥州立大學的生物信息學研究員Rob Edwards教授帶領的研究團隊發現，一種叫做crAssphage的腸道病毒存在於全球70%的人口中，是一種具有特定國家的生物標誌物。

當人類從一個地方旅行到另一個地方時，這種標誌物會迅速發生變化。他們的研究還表明，crAssphage的其它亞型生活在靈長類動物中，可能與人類一起進化了數百萬年。這是全球第一個針對病毒在人類微生物組中全球相似性的研究，結果發表在《Nature Microbiology》雜誌上。

https://doi.org/10.1038/s41564-019-0494-6

數字科學

Edwards和他的同事在2014年通過使用計算機軟體而不是培養皿分析糞便樣本發現了crAssphage的存在。這種數據驅動的方法表明，crAssphage不僅是「一個良性的環球旅行者」，而且是「正常人類腸道病毒的一個組成部分」。

Rob Edwards教授，圖片來源：聖地亞哥州立大學

全球crAssphage 寶可夢

Edwards向科學界發出挑戰，邀請他們加入到對crAssphage的全球尋寶行動中來。

反響非常熱烈：來自六大洲65個國家的117名研究人員、臨床醫生和學者共同分析了32,273種不同的crAssphage序列，發現crAssphage也被稱為噬菌體，是一種特異性感染細菌的病毒，是「人類腸道的世界性居民」。

這一發現的關鍵是由來自世界各地的志願者組成的科學團體，他們通過檢測本國污水處理廠、河流、湖泊和池塘的水，幫助實現了這一目標。

助力個性化醫療

Edwards說：「這一發現說明了病毒如何在地球上傳播，並反映在我們的微生物群落中。我們才剛剛開始觸及表面，但最終，我們可能能夠操縱微生物群來攻擊有害細菌。這將是邁向個性化醫療的關鍵一步。」

End

參考資料：

[1] A common gut virus that maps our travels

[2] Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage

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