康熙設立了一個重要衙門，奇怪的是全部由漢人官員擔任

康熙朝時皇權得到了很大程度的集中，在廢除了輔臣體制後，康熙收回了批紅權，調整內院大學士，並著手建立以皇帝為中心的內閣體制，可以說內閣的成立，確實起到了中樞機構的作用。

除此之外，康熙還標新立異，成立了一個很特別的機構，他在內廷里設立了南書房。南書房是康熙帝為了學習和發揚中原傳統文化、密切漢族士大夫聯繫而建立的內廷機構，由清一色的漢族士大夫組成，沒有固定的編製和人數。少時一二人，多時達十幾人。

康熙十六年冬，三藩平叛戰爭度過最艱難的時刻，已開始出現勝利轉機，康熙為了加強文治做準備。於是命大學士從翰林中選擇博學善書之人，經過反覆醞釀，將張英和高士奇調入南書房，為了方便召見，並在皇城內賜府第。漢官賜第皇城之內由此開始。

繼張英、高士奇之後，康熙又召「翰林院掌院學士陳廷敬、侍讀學士葉方藹、侍讀王士禎入侍內廷」。此後至康熙二十七年之前，陸續入值的還有張玉書、孫在豐、徐乾學等人，凡是入值南書房者，均被授予翰林職銜，稱為南書房翰林。

南書房翰林們的主要工作，可歸納為五項：

第一，講解經史，為皇帝讀書治學充當諮詢和顧問。雖然從康熙十年開設經筵日講，但這遠遠不能滿足康熙帝的需求，他除了每日跟張英學習四書五經之外，還向高士奇學習書法和唐詩，每日至少一兩次課，就連出巡時，南書房翰林也隨侍左右，以便隨時請教。

第二，反映下情，諮詢時政。康熙帝頻繁召對南書房翰林，所談內容極為廣泛，凡國計民生、用人行政無不論及。康熙經常採納翰林們的建議。

第三，抄寫撰擬特頒諭旨，或口傳上諭。一般情況下，南書房並不撰擬詔旨，而是有內閣、議政處負責，行政上的事務由內閣主管，軍國機要，則為議政處主管。南書房在初期時，只是代為謄抄密諭。

第四，編纂書籍。南書房從康熙十七年起，增加了編纂圖書項目。繼張英、高士奇之後，陳廷敬、葉方藹、王士禎等人入值，都是為了「在內編輯」。如《大清會典》、《一統志》以及康熙的《御制文集》等書，都出自南書房。

第五，陪同皇帝吟詩作畫、臨摹書法、參觀古迹、察訪民情。康熙喜歡書法、賦詩，經常於書房翰林一起鑒賞品評，互相唱和。康熙與入值諸臣吟詩作畫、釣魚賞花，無異同堂師友，感情極為融洽。

康熙對待入值南書房的翰林，以師友之情，倍加信任，不齒擢用。張英入值不滿三年，即被提升為翰林院學士兼禮部侍郎，後晉禮部尚書兼翰林院掌院學士，仍管詹事府事。

康熙三十八年，張英致仕前兩年，又拜文華殿大學士兼禮部尚書，仍「總督南書房」。康熙稱讚他「始終敬慎，有古大臣之風」。致仕後，康熙南巡一再接見張英，詢問地方吏治。

自張英之後，桐城張氏日益顯赫，「以科第世其家，四世皆為講官」，子孫五人先後入值南書房。其子張廷玉官至保和殿大學士兼吏部尚書、軍機大臣、總理事務、封三等伯。死後配享太廟，為有清一代名臣。

勵杜訥入值後，賜博學鴻詞科，授編修，遷侍講，轉外後歷任光祿寺少卿、宗人府府丞、左副都御史、刑部侍郎等職，「子孫繼起，四世皆入翰林」，三世入值南書房。其他成為達官顯貴者，亦不在少數。

後人談及南書房說：「南書房在乾清宮之西南，不僅如前代秘書閣、集賢殿人值者止供文翰而已，凡詔旨密勿，時備顧問。」可以看出，這些翰林剛入值南書房的時候地位並不高，甚至很低，是入值後在皇帝扶持下發展起來的漢族新貴族。

康熙設立南書房，加強滿漢文化交流，使自己博古通今，成為文化素質、思想修養和政策水平都比較高的統治者。同時，對團結漢族士大夫，緩和滿漢民族矛盾也起到積極作用。