分子機制研究，從這些明星通路開始……

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作者：麥子（轉載請註明：解螺旋·醫生科研助手）

很多醫生一聽到基礎研究就開始頭疼，如今想發文章、申請基金都得研究分子機制，攻克信號通路大關，不免仰天長嘆：「難道要逼我放棄這個職業嗎？就沒人同情我忙於臨床？到底如何能最短的時間入門呢？」

還好師兄教了我信號通路入門的超實用秘訣，絕對屬於秒殺所有科研屌絲和部分學霸的技能，今天放送給大家。研一的時候，去老闆辦公室確定我的課題，他說讓我研究X信號通路在肝癌中的發病機制，先看文獻下次組會隨便講講。這個「隨便」把我嚇得當場就暈過去了，老闆直接把我扔出了辦公室，砸到地板磚驚醒後我立馬就去抱實驗室博士師兄大腿：

可怕的信號通路

雖說我當時是研究生小白，但好歹跟著聽了幾次組會。師兄師姐講的那些信號通路在我眼中完全無跡可尋，全部錯綜複雜不說，同一個通路中既有好鳥又有壞蛋，還特么特別不專情。就說這P53信號通路吧，只在細胞周期過程中發威就算了，還跟細胞凋亡、細胞自噬、細胞代謝、DNA修復等過程緊密相關；再說一個通路上下游那麼多因子，我哪知道是誰出了問題（當時還不知道要先測序或者做預實驗），所以我大腦中的信號通路完全這個樣子：

信號通路裝逼之三大秘訣

好在師兄是經驗豐富的老司機，在我答應下面一個月承包他所有的細胞換液、傳代工作後（還好只放心把這部分交給我），詭異的一笑：你當我們每次組會ppt上放的通路圖我們自己都記得住啊，只是撐場面的好么！實際上是這樣的：

但老闆還是要「應付」的，他在組會上隨便問你個問題就能套你老底了。比如：你實驗順利的話下游還準備檢測哪幾個marker？往上游還可以怎麼設計實驗？或者直接讓你把這個通路在肝癌中的研究背景介紹一下。麥子你別抖啊，怕啥，你只要記住下面這幾大秘訣，我就能包你對（xue）答（hui）如（hu）流（you）！

Tip1：記住幾個大小BOSS

大Boss是誰？是不是總是聽到一些很牛逼的分子，比如p53、mTOR、Hippo······大Boss們都是處於信號中心，動一發牽全身，所以信號通路常常會以它們命名。還有些大Boss會強強聯手組成一個信號通路的核心，比如TGF-β/Smad、Jak/Stat、PI3K/Akt、MAPK/ERK等。

有些小Boss也是要記的，因為人家同樣功能強大，以它們為主角的相關文獻堆積成山，是傳說中的明星分子，比如：BCL-2、BAX、PTEN、CDK4、caspase系列、KRAS、FOXO1等（不勝枚舉）。其餘小嘍啰們（大Boss遙遠的上下游蛋白），如果不是你研究的對象或者研究對象直接上下游，不要太care，除了蛇精病沒人讓你背出來！

Tip2：向大小BOSS上下游延展

所謂研究機制，入門級的無非是A-B-C三個分子之間（A調控B，C是B的底物）的相互關係，例如A在X細胞中的作用是依賴B和C的，敲除A後BC表達發生改變，用BC的抑制劑或者激活劑可以改變A敲除的效果等等。作為小白，麥子建議你首先要選定自己研究的某個BOSS或者小嘍啰，然後以它們為中心，向上下游「開火」。

比如老闆讓你研究A，這裡以抑癌基因FOXO1在肝癌細胞凋亡過程中的機製為例，要知道FOXO1正好處於PI3K/Akt和MAPK/ERK兩條信號轉導通路的匯聚點：

這時候關鍵的是確定B和C，做了相關晶元的可以去找表達差異基因是否處在這兩個通路中，窮X的實驗室可能就得手動大批量qRT-PCR了。

Tip3：實力裝逼

所謂裝逼，裝的好的是學霸，裝的不好的惹人笑話。別怕，麥子給大家送福利來助攻各位實力裝逼：

1. 資料庫推薦。想要自己對感興趣的信號通路進行查詢，有時間不妨訪問下面幾個比較贊的國外資料庫：

Cellsignal：www.cellsignal.com/index.asp（雖然人家是買抗體的，但網站有很多乾貨）

KEGG：www.genome.ad.jp/kegg/（點此教你KEGG入門）

Nature：pathwayinteraction database

Science：STKE——database of pathway

2. 信號通路圖下載。我給小夥伴們從cellsignal網站下載了一系列高清的信號通路圖pdf版本，可以在微信公眾號中回復「信號通路」下載！

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