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頂級癌症論文的重複性究竟如何?首批結果已出爐

生物通報道 生物學論文難以重複,這已是一個引起人們廣泛關注的問題。近日,癌症生物學重現性項目(Reproducibility Project:Cancer Biology)在eLife上發表首批結果,發現情況不容樂觀。在他們驗證的5篇論文中,只有2篇能夠重複出來。


2012年,Amgen公司的研究人員在Nature上發表評論文章,宣布他們未能重複53篇重要癌症論文中的47篇。無獨有偶,Bayer的研究小組也發現了這一問題。根據Bayer的報告,75-80%的項目被迫終止,因為基礎研究的成果無法重複。


於是,癌症生物學重現性項目於2013年啟動,旨在審查50篇在Science、Nature和Cell等頂級雜誌上發表的臨床前癌症研究的主要結果。不過,因為時間和經費的問題,這個項目的規模已從50篇縮減到29篇。相關人士指出,每項重複工作平均耗時7個月,成本大約為27,000美元。

本周,該項目在eLife上發表了他們重複五項研究的結果。報道稱,它能夠很好地重複其中兩項研究,但這些重複工作也遇到了自己的問題。另外兩項研究不太好解釋,而最後一項研究似乎無法重複。


可重複的研究


Sirota, M. et al. Sci. Transl. Med. 3, 96ra77 (2011)


這項研究證明了潰瘍藥物可減慢腫瘤的生長。它能夠被重複,但統計分析有些不一致。

Delmore, J. E. et al. Cell 146, 904–917 (2011)


這項研究發現阻斷蛋白序列可以抑制癌基因。它也能夠被重複,但對照組的生物發光/存活存在明顯不同。


無法解釋的研究


Willingham, S. B. et al. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 6662–6667 (2012)


這項研究發現,阻斷CD47與另一個蛋白之間的接觸可抑制腫瘤。驗證工作主要針對處理腫瘤的生長和轉移,但發現結果無法解釋,因為一些腫瘤存在自發抑制。

Berger, M. F. et al. Nature 485, 502–506 (2012)


這項研究通過測序發現了黑色素瘤中頻繁突變的基因。然而,驗證工作卻發現,沒有突變的腫瘤也生長得很快,難以支持文章的結論。


無法重複的研究


Sugahara, K. N. et al. Science 328, 1031–1035 (2010)


這項研究發現一種肽段能幫助化療藥物滲透到腫瘤細胞中,從而增強其作用。不過,驗證工作卻發現這種肽段在小鼠身上並沒有此作用。

Nature雜誌與所有這些論文的通訊作者對話。一些人讚揚了重現性項目,而另一些人則擔心這個項目可能會抹黑他們的工作。加州大學聖芭芭拉分校的ErkkiRuoslahti是那項無法重複的研究的通訊作者。他計劃今年對癌症患者進行一項藥物試驗,但現在他的計劃可能有危險。


Ruoslahti對研究結果的裁定提出異議。他指出,美國、歐洲、中國、韓國和日本至少有10個實驗室已經驗證了2010年的這篇論文。「難道我們實驗室中三代的博士後都在自欺欺人,所有的人都在做同樣的事情?我難以相信,」他說。


不過,也有科學家認為,重複工作的失敗可能歸因於文章中的方法細節太少。重複的團隊花了很多時間與原始作者溝通實驗操作和試劑,但在許多情況下,開發實驗操作的學生和博士後已經不在實驗室中。因此,實驗操作可能存在細微的差別。其他人則認為,這個項目的主要價值在於鼓勵人們去懷疑。(生物通薄荷)

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