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張鋒最新Cell子刊文章:兩種新型 CRISPR-Cas 系統

張鋒最新Cell子刊文章:兩種新型 CRISPR-Cas 系統



在最新一篇論文中,著名的 CRISPR 研究先驅:張鋒領導的一個研究小組利用計算序列資料庫挖掘方法,發現了兩種 II 類 CRISPR-Cas 系統——subtype VI-B,這一系統缺乏 Cas1 和 Cas2,包含單個大型效應蛋白 Cas13b,以及兩個以前未描述過的相關蛋白:Csx27 和 Csx28。解析這些新系統的特徵,將有助於研發新型操控和監控細胞轉錄過程的工具。

CRISPR-Cas 系統是細菌的一種獲得性免疫系統,能通過 RNA 導向的核酸內切酶保護微生物免受外源核酸侵害。儘管 CRISPR 由於在基因組編輯方面的重要應用而引發的極大的關注與興趣,但是 CRISPR-Cas 系統也具有重要且基本的生物學意義。並且值得注意的是,這些免疫系統的獨特機制使得它們成為簡單易行的基因組工程工具。可以說,CRISPR-Cas 功能的最引人注目的方面是:這是唯一已知的 「具有可遺傳的基因組記憶的適應性免疫」 的例子,即拉馬克的適應性特徵遺傳的機制。


CRISPR 系統具有多種類型,其中 VI 型 CRISPR-Cas 系統與微生物免疫和程序性細胞生物密切相關,研究表明 VI 型效應蛋白含有兩個 HEPN 結構域,預期具有 RNase 活性,這種需要兩個 HEPN 結構域的活性實際上已經在亞型 VI-A 效應子(Cas13a)上得到證明。


而在最新這篇文章中,張鋒研究組利用一種數據挖掘方法,發現了兩種亞型 VI-B CRISPR-Cas 系統。研究人員發現這些 CRISPR-Cas 系統可以實現異源表達 RNA 干擾,通過進一步的生化和遺傳學實驗,他們發現 Cas13b 會利用短的和長的直接重複片段完成自身的 CRISPR array,切除靶標 RNA,完成 RNase 活性。


此外,研究人員還通過大腸桿菌必需基因篩選,證明 Cas13b 具有雙側前間區序列(protospacer-flanking),解析了靶標所需的 RNA 二級結構。同時 Csx27 抑制的不是 Csx28 增強子,而是 Cas13b 介導的 RNA 干擾。這些 CRISPR 系統的特徵描述有助於研發新型操控和監控細胞轉錄過程的工具。

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