想發5分的文章，又不想灌水？so easy！

今天是六一兒童節

先祝各位乖寶寶節日快樂哦

乖寶寶，要抱抱

好吧

大家都這麼這麼乖巧

今天我們就來分享一篇5分期刊上的文章

而且不是很多單位排斥的Sci Rep 、oncotarget期刊上的哦

最重要的是，它還挺符合臨床醫生構思的文章

開始

今天要聊的文章源自：Cell death & disease

Cell death & disease期刊現在的影響因子為5.3，雜誌創刊時間不長，暫時沒有Sci Rep 、oncotarget那樣的發行量，所以對上述兩個雜誌比較排斥的小夥伴們可以琢磨一下這個期刊。

文章題目：

The novel long intergenic noncoding RNA UCC promotes colorectal cancer progression by sponging miR-143.Cell Death and Disease(2017) 8, e2778; doi:10.1038 .(IF=5.3)

看了題目是不是就有點心動的感覺了呢！

這篇文章通訊作者是廣州中山二院消化內科主任張世能。

文章的主要內容：

作者發現了一條lncRNA-UCC在結直腸癌組織及細胞株中是高表達的。通過統計分析發現UCC表達與結直腸癌淋巴結轉移、分期及預後相關。細胞實驗表明，UCC能促進細胞的生長與浸潤。通過生信預測、雙螢光素酶報告基因分析，以及RIP實驗發現miR-143與UCC結合。實驗表明UCC通過競爭性結合miR-143從而調控miR-143的靶基因表達。

看看張主任是怎麼做的，我們能否借鑒呢？

01.表達譜晶元篩分子

毫無疑問，幾年前單獨的晶元數據就能發不錯的文章了。而現在，只有晶元數據想發文章就已經比較艱難了。

而對於擁有大量臨床樣本的醫生來說，基礎科研的第一步很多人都是從晶元、測序入手，張主任團隊也不例外：

a、通過lncRNA晶元檢測到7419條lncRNAs，其中由124條lncRNAs在結直腸癌及癌旁中存在顯著差異；

b、GO、pathway分析表明絕大數的差異基因與細胞的增殖及死亡調控相關；

c、上傳晶元數據到GEO資料庫；

d、選分子：作者認為上調錶達的分子作為marker或靶標更容易（檢測）些，所以作者就選擇了上調錶達變化倍數最高的lncRNA-UCC作為後續研究對象；

e、定位：實驗確定UCC主要定位於胞核。

02.臨床相關性

a、大樣本驗證：qRT-PCR檢測了78例結直腸癌病人腫瘤及癌旁組織中UCC的丰度，確認有近2/3的病人腫瘤組織中UCC表達水平提升。

b、KM-生存分析：UCC的高表達與不良預後呈正相關

c、UCC高表達與淋巴結轉移、結直腸癌Duke分期相關

03.功能研究

a、細胞實驗：si-UCC後，細胞發生G1/S期抑制、促進細胞凋亡；劃痕實驗表明si-UCC後抑制了細胞的運動能力；Transwell實驗表明敲除UCC後細胞侵襲能力也隨之下降；

b、動物實驗：相對於對照組來說，si-UCC後的結直腸癌細胞成瘤速度和體積均明顯下降。

04.機制研究

a、眾所周知，越來越多的證據表明miRNA可以結合到lncRNA上，引發兩者的丰度變化。

作者通過miRCode、DIANA、LncBase預測到一些能與UCC結合的miRNAs，其中miR-143與UCC有兩個結合位點。

這個組圖是不是很熟悉？

沒錯，就是類似於上次夢熊的三分鐘視頻裡面說到的：這些圖在有些地方是可以用的（點我查看）。

這個圖表明了UCC與miR-143呈負相關。

挽救實驗表明，miR-143的抑制劑能消除因干擾UCC引發的細胞表型變化。

b、研究lncRNA、miRNA無疑就聯想到最經典的ceRNA假說機制。

首先，通過螢光素酶報告基因以及RISC複合物（miRNA、Ago蛋白）驗證了UCC與miR-143結合。

其次，已經報道miR-143的靶分子有KRAS等等，細胞實驗表明干擾掉UCC後能降低了miR-143靶分子的水平，並且通過挽救實驗來驗證了這個結果。

機智的彩蛋分割線

本項目是從樣本出發尋找目的分子，結合臨床預後數據，分子的體內外實驗功能實驗，以及簡單的機制研究，整個思路很清晰明了，基本都是臨床醫生能上手的內容，沒有複雜的機制研究，輕輕鬆鬆上5分。

還很模糊嗎？

沒關係，小張手把手教你！！！

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