手把手教你探索KEGG Pathway

中科新生命，成立於2004年，專註於質譜技術方法在科技服務、生物醫藥、精準醫療領域的應用開發。12年質譜服務經驗，每年處理本數超萬例，通過與中科院的技術合作及企業研發團隊的自主創新，致力成為您最具價值的生物技術合作夥伴。

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KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因與基因組百科全書)是系統分析基因功能的綜合性資料庫。其核心之一的KEGG Pathway是根據相關知識手繪的代謝通路圖，劃分為6類：分別為Metabolism, Genetic information Processing, Cellular Processes,Environmental information Processing, Organismal Systems, Human Diseases。其中每類又分為二、三、四級子條目。

KEGG Pathway的簡單探索攏共分4步！

第一步，首先你需要打開KEGG的主頁。鏈接_http://www.genome.jp/kegg/

第二步，直奔主題，點擊KEGG Pathway。在這個界面，就會看到六大一級分類條目啦！在一級分類下，還有更具體的二級分類條目。

第三步，在一級條目Metabolism下點擊二級條目「Energy」，其三級子Pathway列表就會粗線在界面最上端。

第四步，選一個三級子Pathway點進去，依照其研究的完善程度，呈現的具體代謝通路圖有可能是這樣嬸兒的

也有可能是這樣嬸兒的

這些KEGG Pathway中包含了大量蛋白、化合物的信息，以及它們之間的相互作用關係。我們需要讀懂各種代碼和符號的含義。

最後害有一丟丟：

如果我不知道任何MAP號，KO號，想查找一個目標蛋白（或代謝物）所在的通路怎麼辦（手動攤手）？

（終於找到地方插表情包了）

細心的你一定發現了，在Pathway的界面還有一個搜索框。可鍵入關鍵詞進行搜索。舉個栗子鍵入「SYT(突觸結合蛋白)」，GO。該蛋白參與的代謝途徑信息列表就會呈現啦！

如果搜索沒有結果，檢查一下蛋白的拼寫，試試縮寫，區分下大小寫（KEGG有時候區分大小寫）。如果還是沒有結果，那就可能是該代謝通路研究尚不完善，沒有對應的Pathway信息啦！

今天KEGG Pathway就先探索到這兒，如果你對此特別感興趣，可以來參加中科新生命的夏季培訓班— SCI文獻中的代謝組學技術應用，通路分析也會細講哦~

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