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有思想也要軀體,二者統一才是人類

如果有一天,我們所看見的生命都是機器合成的,那麼我們是不是本身已經不是人類了?這個問題值得我們思考。就像駭客帝國中,我們是思想並不能確定我們就是人類。因為小編認為軀體同樣重要,我們是統一的。

克雷格·文特爾, 當下地球面臨的種種危機,令我們總是寄希望於終有一日逃離地球,飛往另一個可宜居的星球,至於我們應該如何到達那個星球以及在我們有限的生命里能否到達,估計沒人能給出合理的方案。近年發現的類地行星開普勒452b,與地球大小非常接近,但是它距離地球非常遙遠,1400光年,即使我們乘坐當下最先進的飛行器,飛行1400年也到達不了這個星球。

生物狂人克雷格·文特爾在《光速人生》(Life at The Speed of Light)一書中,給了一個很有意思的解決方案: 那就是讓「生命」乘坐「時空隧道」以光速飛向另一個星球。不過這裡的生命僅指生命密碼,由A、C、T、G組成的生命的密碼與計算機中的基本語言0和1可以互換,生命密碼可以電磁波形式向外太空傳輸。

至於生命的密碼到達另一星球,該如何自動合成,這就是5月29日文特爾研究團隊發表在《自然-生物技術》(Nature Biotechnology)上的一項研究提出的可能解決方案。不過其離真正的生命個體合成還非常遙遠,目前僅限於遐想空間。夢想是要有的,萬一它實現了呢?

長期以來,分子生物學家都希望從設計一段DNA序列到拿到這個序列相關的活性物質,這之間所有的實驗完全通過機器來實現。

近日,由克雷格·文特爾(Craig Venter)和丹尼爾·吉布森(Daniel Gibson)開發的Digital-to-Biological Converter(DBC)實現了這一目標,相關研究發表在《自然-生物技術》雜誌。據介紹,這是同類工作中,第一篇發表的同行評議論文。

文特爾的搭檔,本項研究的主要作者Daniel Gibson  傳統的同類實驗大概要花費至少一周的時間,由訓練有素的實驗人員完成。基本操作過程包括:設計需要合成的基因,由合成軟體將要合成的基因,拆解成DNA合成儀可合成的短片段。

受到化學合成準確性的限制,目前還是以合成約60~70個核苷酸,通常實驗室無法完成DNA合成的工作由商業公司完成,比如合成的基因片段長4000個鹼基,那麼我們至少需要合成4000/70=58條的單鏈核苷酸。這個過程通常要花費兩三天時間,然後將這些短的單鏈DNA組裝,並通過PCR的方法使其形成雙鏈DNA,再將雙鏈DNA裝入到載體質粒裡面,通過非細胞(或者細胞)結構的轉錄和翻譯體系進行轉錄翻譯,並最終得具有活性的蛋白。

從序列到具有生物活性的RNA、蛋白質以及病毒粒子,

DBC真容,儘管看上去沒那麼高大上,但是它卻能從實現從數字到生命過程的全自動轉變, 整個實驗過程通常要使用數個設備,如PCR儀、恆溫培養箱、凝膠電泳系統和凝膠成像系統、純化系統等,主要過程包括DNA的合成,組裝和擴增,載體的連接,轉錄和表達等幾個重要階段。

此次設計的DBC集成化程度很高,甚至集成了DNA合成儀,它還採用了2X96的格式進行DNA合成,因此最大的合成通量定在了約為2X96X70=13440個鹼基,可簡單地理解為13440鹼基之內的DNA都可以直接合成。研究者只需要輸入設計好的DNA序列,DBC就可以按照既定的程序,從合成短片段的單鏈DNA開始,一直到最後階段的蛋白表達,均可集成到一個自動化系統裡面,可以說是一鍵完成了。此外,作者還優化了RNA疫苗的合成、病毒的複製以及噬菌體的產生等可能的使用領域。

但DBC也非橫空出世。在這之前,硬體的主要提供商SGI—DNA公司已經有了從基因到克隆的自動化產品,只是集成的功能不如DBC強大。合作方Synthetic Genomics公司旨在人工設計和合成基因組,正如之前文特爾研究組合成的人工生命體Synthia一樣,通過化學合成的方法合成基因組,將其導入到去掉染色體的細胞結構中,產生新的生命。真有些強大到沒朋友的感覺。

DBC是人類向合成生命探索的一個階段性成果,在合成生物學實驗室推廣DBC,將大大加速人工合成基因的效率,加速人工合成生命的發展。不過客觀地講,DBC並非革命性的工作,DBC是將原來需要人工完成的工作自動化、集成化,並沒有新的設計思路。

下一階段,相信任何「人力」也無法阻擋文特爾在合成生命上的腳步,DBC將推進人工合成基因組的發展,幫助人們更好地理解生命的本質問題。沒準真的有一天,人類需要太空移民,這項技術可以幫上忙。


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