標準腸道菌群——「Normal」 for the gut microbiota

最新 07-13

Everybody knows，腸道微生物的組成和結構對人體健康十分重要，學界也針對人類腸道微生物做了很多研究。只不過這些研究大多是針對某些疾病的，也就是通常聚焦於「不正常」的樣本進行研究。那麼，「正常」（Normal）的，或者說一般人的腸道微生物組成是什麼樣的呢？最近就有一篇研究報道針對該問題進行了闡述。

宏基因組學分析揭示腸道微生物構成和多樣性的標誌物

介紹

對於臨床研究來說，確定「正常」的腸道微生物群落是如何構成的非常重要，當然，前提是存在這種構成。

通過糞便樣本和問卷調查，Falonyet al.和Zhernakovaet al.等人分別研究了比利時和荷蘭人群。腸道微生物的組成與一系列因素有關，包括日常飲食、用藥、血紅細胞數、糞便嗜鉻粒蛋白A和糞便稠度等。這些數據能夠為正常腸道微生物菌群的可能生物標誌物提供一些提示。

結果

圖1 微生物分類樹。（A）基於宏基因組測序的分類樹（B）基於16S rRNA基因測序的分類樹

圖2 微生物組成和功能之間的個體差異。（A）微生物組成的PCoA圖（B）香農多樣性指數分布圖（C）基因丰度分布圖（D）直系同源群簇（Clusters of Orthologous Groups，COG）丰度的分布

圖3 與腸道微生物中個體間差異有關的因素。共展示126個相關因素（FDR

圖4 排泄物中CgA相關分析。（A）微生物組成的Bray-Curtis距離圖（B）CgA與其他因素的相關性（FDR

結論

這篇文章利用二代測序技術在1135個荷蘭人群體中進行了腸道微生物的深度測序，得到了微生物與人之間126種（外源性和內部宿主）因素的關係，包括31種內在因素，12種疾病，19種藥物組，4種吸煙類別和60種飲食因素。這些因素共同解釋了整個微生物群體中個體間差異的18.7%。該研究將110種因素與125個物種聯繫起來，發現糞便嗜鉻粒蛋白A（Chromogranin A，CgA，由腸內分泌細胞分泌的蛋白質）與61種微生物非常相關，其丰度占微生物組成的53％。在多樣性更高的微生物群體里的個體中觀察到了低CgA濃度。這些結果能夠引導我們更好地了解環境-飲食-微生物-宿主之間的相互作用。

參考文獻

Zhernakova A, Kurilshikov A, Bonder M J, et al. Population-based metagenomics analysis reveals markers for gut microbiome composition and diversity[J]. Science, 2016, 352(6285): 565-569.

技術支持部

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