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防患於未然,DNA測序中隱藏著的計算機安全威脅

華盛頓大學研究團隊:未來生物醫學將與計算機安全同氣連枝。

近日,華盛頓大學研究團隊圍繞DNA序列轉錄與分析的基礎安全設施進行了研究與分析,發現了世界各地實驗室使用的開源軟體的基本漏洞,提出需要重視DNA測序安全問題。

經過近十年來的發展,DNA序列分析所需的成本和時間已經大幅降低,其中測序一組基因的成本已經降低到原來的十萬分之一。對此,研究人員表示,這種改進速度之快源於現如今的DNA分析技術大多採用大規模的並行處理。

目前,現有的測序技術已經可以實現同時對數億個DNA序列進行排序。在DNA 測序過程中,需要計算機來處理、分析和存儲單個DNA樣品中測序出的數十億個DNA鹼基。即便只是利用排序機來排序,它也是在計算機上運行的。

故而現在電子和生物系統之間存在不可分割的聯繫,對此研究人員Luis Ceze補充說道:「隨著分子與電子世界越來越緊密,我們就不得不考慮它們之間的潛在互動。」

計算機安全和DNA操縱交叉學科的研究人員表示,希望了解生物分子信息與分析信息的計算機系統之間的相互作用,以及相互作用下有可能出現的計算機安全風險。

因此,研究團隊試圖通過像CRISPR這樣的工具進行探索:首先,他們將DNA看作是包含生命信息的文件系統,接著利用分析程序讀取DNA鏈的鹼基(胞嘧啶、胸腺嘧啶等,我們都知道的A、T、G、C),並將其轉化為二進位數據輸入計算機進行處理。

在這一過程中,研究人員表示,有兩點細節之處值得注意:一是DNA測序儀未能遵循計算機安全方面的最優編碼原則;二是在DNA序列中存在編碼惡意軟體的可能性。

問題一|未遵循最優原則

通常,在DNA測序後,會讓其通過DNA數據處理通道,在經過通道時讓多個計算機程序對其進行處理和分析。從通道中,研究人員獲取了常用的開源程序,並針對計算機安全層面分析了這些程序,結果發現它們都沒有遵循計算機安全方面的最佳編碼準則。

現有計算機編程方面,原則上存在著不可避免的安全問題,因此在此過程中,有研究人員探尋出安全問題與易受攻擊的代碼之間的關係準則。在DNA測序中,由於開源程序並未遵循最佳準則,如果攻擊者瞄準該通道,則DNA排序數據處理通道的安全性將會受到威脅。

問題二|存在序列漏洞

測序前,DNA首先存儲標準的核苷酸,即DNA的基本結構單元(如A、C、G、T等字母所表示)。待其測序後,計算機程序再對該DNA數據進行處理和分析。從計算機安全層面來看,任何用作程序輸入的數據都有可能包含危及計算機的代碼。因此,既然可以實現排序和分析功能,也就有可能存在含有惡意計算機代碼的DNA鏈,且會對計算機造成一定的損壞。

為了證明該理論的正確性,研究人員在DNA處理程序中加入了一個已知的安全漏洞,隨後,他們設計併合成了一個DNA鏈,其中包含了在DNA鏈基礎上編輯的惡意計算機代碼。當DNA鏈被含有安全漏洞的程序排序和處理時,同時它也反過來對計算機進行遠程控制,即研究人員能夠使用合成的DNA鏈來獲得對計算機的完全控制。這也就意味著惡意DNA鏈會對計算機造成致命的打擊。

總結

研究團隊表示,目前威脅尚不存在。對此,項目的研究科學家Lee Organick說:「製作的生物樣品確實可以用作惡性DNA的載體,在測序後進行下游處理,然而,將惡意的DNA鏈從編輯的樣本導入排序器是非常困難的,且存在許多技術挑戰。即使能順利地將它放入排序器進行排序,它也可能沒有任何可以使用的形狀(如它太分散,不能被有效地讀取)。」

不過,該研究團隊強調,雖然沒有證據表明DNA測序或DNA數據的安全性正在受到威脅,但我們應當防患於未然,將這些結果作為DNA測序生態系統中計算機安全問題研究的第一步。計算機安全研究的一個主題是,在技術成熟之前,最好在新興技術的早期發展階段考慮安全威脅,因為安全問題在真正顯現之前更容易解決。

研究人員還表示,鼓勵DNA測序在編碼生物信息學軟體時遵循最佳準則,特別是用於商業或敏感之處時。此外,在應用時,還應當考慮來自各種來源的威脅,包括被排序的DNA鏈、作為計算機攻擊的載體等。未來,生物醫學安全問題無疑要與計算機安全緊密聯繫。


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