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第三代測序,真的上天了

第三代測序,真的上天了



本周一,牛津納米孔公司的MinION測序儀跟隨美國太空技術探索公司SpaceX的太空艙到達了國際航空站,它是迄今為止首次登上太空的測序儀。接下來,美國宇航員兼微生物學家Kate Rubins將使用MinION在太空中對細菌、病毒以及小鼠進行基因測序,這也是人類首次在太空中進行此類試驗。

該試驗的目的是為了證實能否利用該技術來了解空間站中的微生物,或檢測宇航員的遺傳變化以幫助其診斷疾病,或在未來檢測火星及其他星球中基於DNA形式的生物體。


首先科學家要證實的第一件事情就是測試MinION測序儀在失重狀態下的運轉情況。上周六,Kate Rubins抵達了國際空間站,在接受路透社採訪時,她表示,「技術在這裡表現得有所不同,流體的行為在這裡也有所不同。」因而科學家們首先要了解的是MinION在太空中的流體動力學。


科學家認為,空間站是檢驗儀器在極端環境中的性能和數據處理能力的最佳地點。在本試驗中,科學家除了要確定MinION在失重環境中的性能之外,還想開發出能在太空中直接分析數據結果的系統。


MinION測序儀只有半個智能手機那樣大,美國國家航空航天局、休斯頓約翰遜航天中心的微生物學家Sarah Wallace說,「MinION的工作原理與當前的DNA測序完全不同。對於大多數測序儀,進樣後要運行24到48小時,而對於 MinION測序儀,研究人員在進樣幾分鐘後便可獲取序列數據,儀器運行多久取決於研究人員想要探索的科學問題。」

期望:在極端環境中幫助人類診斷疾病


MinION測序儀登上太空,科學家們不是為了證明基因測序的飛速發展,而是想利用其來幫助人類在極端環境中診斷疾病。


對於該試驗,Rubins宇航員有自己的一些期望,她說,「目前,我們不能實時分析太空中發生在人類以及細胞中的事情。我們的空間站擁有一個具有15年歷史的乾淨水源,但是這些水源是否存在微生物還無人知曉,也許DNA測序儀可以幫助我們解答這個問題。」


目前,MinION測序儀在太空中與其他的診斷儀器相連,例如PCR儀。如果MinION能把太空中的微生物都「鑒定」出來,那麼它有望幫助空間站中的宇航員診斷疾病,以了解致病微生物是否對抗生素敏感,這樣一來可以節省太空中寶貴的藥物。


在太空中完成DNA測序,同樣為偏遠地區或地球上貧困地區的DNA測序鋪平道路。Rubins 說,「這類裝置可在疫情爆發時、或在沒有足夠的設備資源的診所中進行一定類型的疾病診斷。」

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For the first time, scientists to sequence genes in space

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