《轉》譯：不做實驗也能發高分文章？公共數據分析驅動免疫治療

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《轉》譯

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近期，Sanford-Burnham Prebys醫學研究中心(SBP)的科學家研究揭示了100多種新的癌症免疫治療相關基因位點。對應論文發表在最新的 Cancer Immunology Research，名為「Mutation drivers of immunological responses to cancer」。 SBP研究中心科學家認為其研究成果可以幫助癌症免疫療法領域同仁開發更多新型免疫系統強化療法以提高癌症治療水平。

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「通過對大型公共基因組資料庫數據的分析，我們找到了122個潛在的免疫反應驅動基因。這些基因的突變與否與免疫細胞對腫瘤組織的侵入性息息相關。」SBP博士後研究員，文章主要作者之一Eduard Porta-Pardo博士說。「儘管這122個基因中的少數幾個已經被報道與免疫反應中的重要蛋白質具有相關性，但我們發現的大多數基因位點還是第一次被證實與癌症免疫治療有關。我們的研究為癌症的免疫治療提供了諸多新的靶點。」

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過去幾年，癌症免疫療法的進步促使科研人員開發了數種新型的治療性化合物以及治療策略。由於可以治療已經擴散至其他器官的晚期癌症，癌症免疫療法被視為癌症治療技術發展的重要拐點。目前，已經有少數幾種癌症免疫療法有關藥物被廣泛應用於治療癌症並在臨床取得了巨大成功，完全清除了患者體內腫瘤組織或使腫瘤組織明顯減小並能夠對癌症的複發起到預防作用。

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「為了開發能夠應用於多種癌症治療的免疫療法，我們需要更加深入和全面地了解免疫系統與腫瘤組織之間的相互作用。」SBP生物信息學和結構生物學項目主任，文章的主要作者之一Adam Godzik博士強調，「我們的研究很大程度上拓展了人們在這個方面的知識。」

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目前，大多數癌症免疫療法都基於相似的策略--解放病人免疫系統使免疫功能充分釋放。在免疫系統有效識別腫瘤威脅並賦予免疫細胞腫瘤侵入性的情況下類似的癌症免疫療法都能表現出極好的效力。但是，有些癌症卻能逃過免疫細胞的識別，以一種未知的方式阻止免疫細胞的侵入。

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「基因突變位點決定著蛋白表達水平的變化，而我們的工作正是精確地探索這些有關基因發生突變的具體位置。」Porta-Pardo博士強調，「我們使用domainXplorer演算法識別了不同基因分型之間的相關性，探明了具體突變對於腫瘤組織中免疫細胞數量以及蛋白功能結構域的影響。」

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「我們研究進一步向世人展現了數據共享的強大潛力，」Godzik博士強調，「正因為我們能夠訪問癌症基因組圖譜(TCGA)中超過5000例的腫瘤樣本及其基因組數據，我們才能免於進行冗雜的項目合作以及樣本數據採集工作，直接進行最終的基因組數據分析。下一階段我們計劃應用domainXplorer演算法研究腫瘤組織侵入能力較強免疫細胞的有關基因，進一步揭示癌症免疫治療的更多細節。」

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