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APG IV系統學習筆記分享(一)

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APG IV系統學習筆記分享(一)


第一章 緒 論


一、什麼是被子植物APG系統?


APG系統,也稱為APG分類法,是指被子植物系統發育研究組(Angiosperm Phylogeny Group)以分支分類學和分子系統學為研究方法提出的被子植物分類系統。 自1998年首次提出APG I之後,2003年發布了APG II,2009年發布了APG III,2016年發布了APG IV。

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二、APG系統與其它植物分類系統有什麼區別?


千百年來,人們不斷地對身邊的植物加深著了解,當種類越來越多的時候,就要把植物的物種分清楚,並且要分門別類地記錄下來,這個時候就需要植物分類系統,同時也就有了植物分類學家。


世界上所有的植物分類學家都希望建立一個理想的分類系統。在這個系統里,按照植物在地球出現的順序來擺放,親緣關係近的放在一起,就好像有一棵生命樹,枝條頂端的葉片就好像是一個個物種,小枝條把葉片集中在一起,大枝條又把小枝條集中在一起,最後主幹把所有的大枝條集中在一個根基上。然而,繪製生命樹這件事情說起來容易,做起來可就太難了。

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長久以來,植物學家們主要通過觀察、實驗和統計的方法,依據植物形態特徵的不同劃分物種,並根據重要特徵的進化先後順序把植物按照界、門、綱、目、科、屬、種的等級,繪製出一幅幅看上去彼此都很像的生命樹,但是仔細觀察以後,很多細節非常迥異。


這是為什麼呢?因為植物分類學家們的觀點不一樣。有時候,不同的植物學家根據不同的形態特徵來規劃自己的生命樹,這就好比都是畫工筆的兩位畫家,一個畫魚鳥,另一個畫花草;有時候,一個特徵在某些植物學家的眼裡是進化的,而在另一些植物學家的眼裡卻是原始的,這就好比畫油畫的碰到了畫水墨的,畫風不一樣。於是,在人世間就出現了很多的植物分類系統。其中,有的非常接近,而有的就相差甚遠。


但是隨著時間的推移,到了近代,由於科學技術的迅速發展,植物學研究也日新月異,很多植物分類系統不斷得到修正,趨同的方向日益明顯。當迅猛發展的分子生物學出現時,植物分子系統學大有一統天下之勢。


植物分子系統學利用生物大分子,如蛋白質和核酸(包括DNA和RNA),主要是核酸分子。核酸分子具有良好的遺傳穩定性,上面的基因組帶有大量的遺傳信息,有些基因組,如葉綠體基因組(cpDNA),在分子水平上,既存在差異,又相對保守,這些數據非常有利於系統發育學研究,不僅可以區分由共同祖先帶來的同源性,還可以區分由於趨同進化從不同祖先帶來的相似性。根據核酸分子或者蛋白質分子數據繪製出的生命樹客觀性更強。

上面這段話有點不容易懂,我們換個通俗的說法來理解。長久以來,我們習慣於把外貌長得相像的物种放在一起,認為它們的親緣關係比較接近,對於外貌長得大相徑庭的物種,則認為親緣關係很遠;然而,在自然界里,總是有始料未及的現象:有時候,長得很像的植物之間親緣關係很遠;而相貌差異很大的植物卻系出同門。舉個例子,朴樹屬(Celtis)植物從形態特徵上來看,與榆屬(Ulmus)、櫸屬(Zelkova)一起放在榆科(Ulmaceae)看上去再和諧不過了,然而,通過比對DNA序列,發現朴樹屬(Celtis)與大麻屬(Cannabis)、啤酒花屬(Humulus)親緣關係更近,放在大麻科(Cannabaceae)更自然,更客觀。


這就好比《楊家將》故事裡替死的任炳和楊六郎相貌極為相似,卻與楊六郎沒有絲毫血緣關係;而佘太君生下的七、八個兒子中,相貌和性格都各不相同。這就是說,長得像的未必親緣關係就近,長得不像的也未必親緣關係就遠。


這樣的例子在APG系統里並不少見,給習慣於原有分類系統的人們帶來很大的煩惱。有的人捶胸頓足,破口大罵APG沒有人性;有的人城府較深,仔細觀察,不發表任何言論,靜觀其變;有的人積極面對,逐漸開始學習、研究、了解,並開始在工作中運用APG。


當然,APG系統在發展的過程中,還會遇到很多困難和質疑,但是,就目前的研究進展來看,在目和科的水平上已經趨於穩定,基本框架已經成熟,將來的困難主要集中在某些奇葩科里的某些奇葩屬的水平上了,總體上來說,已經確定了一統天下的大勢所趨。

三、為什麼要學習APG系統?


現在國內對於APG系統的認識還在初始階段,但是歐美一些大學植物分類課程本的科教材中已經普遍使用APG系統,很多植物園的牌示系統正在更換中,後台的植物登記資料庫也正在更換為APG系統。因此,現在或者將來打算從事農林牧漁、園林園藝、醫學醫藥等生物類學科的小夥伴們就要抓緊時間跟上步伐,以免將來後悔莫及。


四、本系列文章適合怎樣的人群閱讀?


本系列文章將有若干篇持續連載,完全是筆者本人的學習筆記,這裡與大家分享,共同學習。歡迎專家拍磚和愛好者拋玉討論,大家一起成長。主要適合人群如下:


植物愛好者、花友,植物分類知識欠缺的;


植物工作者,但非植物分類專業研究者;


家長朋友們,尤其是家裡有小朋友喜歡植物的;


大學裡樹木學、花卉學、植物學70分以下的;


農林專業畢業的、從事行政工作2年以上的;


等等。


只要您願意的,都可以了解並與周圍的人分享。只有那些捶胸頓足,破口大罵APG沒有人性的人,請慎入。


好,先上一個圖,這就是APG IV系統里被子植物的基本類群,包括:ANA基部群、木蘭類、金粟蘭目、單子葉植物、金魚藻目、真雙子葉植物。

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是的,讓我們從最簡單的開始。可是,有的人會說,怎麼看上去有點亂呢?對,是有點亂,這也就是我們要下回分解的內容。


今天就到這裡,休息,休息一下。

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(未完待續........)


本文圖片均來自網路。


參考文獻:


https://en.wikipedia.org/wiki/APG_IV_system


https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_systems_of_plant_taxonomy


http://www.honda-e.com/


Angiosperm Phylogeny Group (2016), An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG IV, Botanical Journal of the Linnean Society 181 (1): 1–20.


劉冰, 葉建飛, 劉夙, 汪遠, 楊永, 賴陽均, 曾剛, 林秦文. 中國被子植物科屬概覽: 依據APG III系統[J]. 生物多樣性, 2015, 23(2): 225-231

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