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科學家發現亞洲人特異的心房顫動基因突變

科學家發現亞洲人特異的心房顫動基因突變

心房顫動是一種心律失常,估計影響全球 3300 萬人群。之前已發現了十多個變異與歐洲人的心房顫動風險相關,1 個變異與亞洲人的心房顫動風險相關。

在 4 月 18 日發表在《Nature Genetics》上的兩項獨立研究中,研究人員通過薈萃分析和全基因組關聯研究發現了其他心房顫動風險變異,使這種變異的總數達二十多個。另外,這兩項研究均表明 SH3PXD2A 附近的變異影響亞洲人的心房顫動風險,SH3PXD2A 編碼 invadosome 相關的支架蛋白,SH3PXD2A 在人類心房和心室中表達,對神經鞘遷移很重要。

在第一篇論文中,Broad 研究所 Patrick Ellin 領導的心房顫動遺傳學(AFGen)聯盟對全基因組關聯研究、全外顯子關聯研究和罕見變異關聯研究進行了薈萃分析,包括大約 22,300 例心房顫動患者和 132,000 例對照。在使用 BioBank Japan 研究和 UK Biobank 的病例和對照進行複製研究後,AFGen 聯盟確定了 12 個新的與心房顫動風險相關的基因位點。

研究人員指出,現在有 7 個心房顫動相關的基因位點與心電圖特徵、左心室內舒張期直徑和中風等表型相關。此外,這些風險基因位點附近的許多基因編碼鉀或鈉通道。他們還發現了一個與 SH3PXD2A 相關的變異,是亞洲人所特有的。

在另一篇文章中,Riken 綜合醫學中心的 Toshihiro Tanaka 進行了一項 GWAS 分析,利用 8,180 例心房顫動病例和 28,612 例對照尋找日本人的心房顫動風險變異。在進一步分析了 3,120 例病例和 125,000 例對照後,他們找到了 6 個新的心房顫動風險相關的基因位點,位於 KCND3、PPFIA4、SLC1A4–CEP68、HAND2、NEBL 和 SH3PXD2A 附近。

他們又使用 AFGen 聯盟的 GWAS 薈萃分析數據(包括 16,000 例病例和 113,700 例對照)進行計算機複製研究,發現最顯著關聯的基因位點是 SLC1A4-CEP6,而其他 SNP 僅為名義上關聯。這表明兩個研究隊列間存在異質性。

總的來說,Tanaka 等人發現,在他們的日本人隊列中與心房顫動最顯著相關的位點是 HAND2 基因,HAND2 編碼心臟形態學相關的蛋白。該變異的次要等位基因在東亞人中更常見。

Tanaka 等人在論文中寫道,「由於不同人群的複雜連鎖不平衡結構和不同的環境暴露,確定特定人群的心房顫動風險因素非常必要,因為這些可以用於更好地預測不同地區心房顫動的風險。」

參考文獻:

Large-scale analyses of common and rare variants identify 12 new loci associated with atrial fibrillation. Nature Genetics (2017) doi:10.1038/ng.3843

Identification of six new genetic loci associated with atrial fibrillation in the Japanese population. Nature Genetics (2017) doi:10.1038/ng.3842

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