中藥復方SCI如何突破5分大關？

應用網路藥理學和生物信息學技術研究中藥復方/單體作用機制的學習班

——中藥復方SCI如何突破5分大關？

瑋瑜主辦

2017年7月29日-30日（周六日）

上海

課程簡介

中藥復方以及中藥單體配伍製劑是現代中醫治療疾病的主要方式，它通過潛在的成分-靶點相互作用來治療各種疾病，在降低不良反應的同時最大化治療效果。然而，由於中藥的成份多、作用機制複雜的特點造成了中藥作用機理的不明確，研究難度大，尤其是在SCI論文發表過程中無法獲得認可和支撐。

近年來，隨著網路藥理學和生物信息學的發展，將生物信息學技術和網路藥理學方法相糅合，聯合實驗驗證成為中藥復方機制研究中的重要方式之一，在SCI論文發表方面獲得了新的進展。基於該模式的中藥復方研究打破了傳統的中藥復方機制研究的瓶頸，使得原先難以定性的機製得以預測和驗證。該研究方法適用於各類病症的中藥復方/單體治療機制研究，現已成功應用於多篇SCI（IF＞5）論文的使用和發表。與此同時，中藥單體和復方的研究成為近年來研究的熱點和國自然基金重點扶持的領域，作為臨床醫生、科研人員和碩博士研究生，尤其是沒有生物信息學分析基礎和網路藥理學基礎的初學者，在面對錯綜複雜的數據時，難免會無從下手，遇到一個小小的技術難點總會卡住很久，研究進度十分緩慢。不知道如何去解析一個中藥復方的作用機制，如何去挖掘成分-靶點之間的關係，如何將藥物作用機制和疾病機制相關聯？如何利用免費的數據挖掘，為自己的中藥復方研究增添亮點？如何利用生物信息學技術，解析中藥復方作用機制？

本次學習班將帶領廣大學員，共同學習將網路藥理學和生物信息學相結合的中藥復方研究思路，輕鬆突破中藥復方SCI文章的5分魔咒。現場實戰教學，帶領學員解析中藥復方作用機制，學員也可以將自己研究的復方帶來學習班，利用課間時間解析中藥復方作用機制。

課程內容、目標與特色

本次學習班課程嚴格按照中藥復方解析的順序設計，層層遞進，逐步挖掘中藥復方的作用機制。將講述如何利用VBA工具檢索復方成分並使用ADME參數篩選有效成分；如何利用VBA工具檢索成分靶點；如何使用藥效團靶點預測工具開展中藥單體成分的機制研究；如何使用Cytoscape構建網路和進行網路拓撲分析，以及多種插件的靈活使用；講述如何將GEO資料庫和Connectivity Map資料庫應用於中藥復方的機制研究；如何利用Cytoscape構建多資料庫來源的蛋白質相互作用網路；如何利用MCODE演算法篩選網路核心模塊；如何利用簡單在線工具進行富集分析和富集散點圖、文恩圖的繪製。

本次學習班全程電腦實戰教學，90%以上為上機指導操作，無繁瑣的理論授課，做到課程學完，就能獨立解析中藥復方，分析復方治療疾病的潛在分子機制，並進行後續的實驗驗證研究提供指導。

授課老師

本次主講老師成功將網路藥理學和生物信息學技術相結合，應用於中藥復方的機制研究，發表和參與發表多篇5分以上的中藥復方機制研究的文章。

適合對象：

各級醫院臨床醫生、藥師、科研單位研究人員、高校碩/博士研究生、對中藥復方和網路藥理學感興趣的廣大師生（尤其適合初學者和無基礎的學員，無需任何基礎，也無需學習任何R語言，輕鬆解析中藥復方）

課程設置

第一天上午：

中藥復方有效成分的篩選、靶點預測和分析

1. 中藥復方網路藥理學和生物信息學結合的SCI文章套路學習

2. 中藥有效成分的查找和基於ADME參數的成分篩選（包括使用VBA工具快速獲取中藥成分信息數據，上機實戰）

3. 中藥有效成分對應靶點的獲取、整理和基因名轉換（包括使用VBA工具快速獲取成分-靶點關係數據，上機實戰）

4. 基於藥效團模型的中藥單成分/化合物的靶點預測（包括PubChem資料庫的簡單使用和成分3D結構文件的下載，上機實戰）

第一天下午

疾病相關靶點的檢索和生物信息學技術在中藥復方中的應用

1. 基於網路藥理學的分子對接靶點驗證（快速分子對接，單個成分多個靶點對接或者多個成分多個靶點對接，簡單易學，適合初學者，發文章夠用，上機實戰）

2. 疾病相關靶點的檢索和獲取（通過多個資料庫聯合檢索疾病相關的已知靶點，實戰演示）

3. GEO資料庫分析和獲取特定疾病靶點（包括GEO資料庫的簡單介紹，GEO晶元的在線分析和利用在線工具進行GEO晶元的分析，繪製熱圖，非常適合沒有R語言基礎的初學者，上機實戰）

4. 利用文本挖掘工具檢索疾病相關靶點，增加疾病靶點可靠性。

5. 基於ConnectivityMap的中藥復方或單成分的機制研究，以及相關耐葯研究的思路探討。

第二天上午：

成分靶點網路構建和Cytoscape詳細使用

1. 多種方式繪製文恩圖，交集分析。包括在線工具、軟體等方式，最多支持6組的文恩圖分析，無需任何R語言基礎，上機實戰。

2. 成分-靶點網路構建過程中數據文件的編排以及網路繪圖的注意事項，上機實戰

3. Cytoscape軟體以及相關插件的詳細使用（包括中藥復方成分-靶點網路繪製、網路美化和調整、交集網路構建、子網路提取構建、圖片導出和數據導出等，上機實戰）

第二天下午：

中藥復方作用機制分析和其他分析手段拓展

1. 常用蛋白質相互作用關係資料庫的介紹以及使用Cytoscape插件快速構建蛋白質相互作用關係網路，並使用拓撲分析和MCODE分析，尋找蛋白質相互作用網路中的關鍵節點，構建子網路，上機實戰。

2. 基於DAVID的靶點GO注釋分析和KEGG信號通路分析，以及利用在線工具繪製富集散點圖，利用Bingo、GlueGO等Cytoscape插件進行富集分析和結果繪圖，上機實戰。

3. 常用網址的使用和簡單教學（包括簡單的miRNA靶基因預測、文本演算法挖掘工具簡單教學等，根據時間安排，上機實戰）

備註：

自帶筆記本電腦，安裝WINDOWS操作系統，需要安裝Cytoscape3.2.1（需要安裝java，具體插件報名後告知如何安裝）、OfficeExcel 2010等軟體。

主辦單位

上海瑋瑜生物科技有限公司

時 間 地 點

會務時間：2017年7月29日-30日 28日報到

會務地點：田林賓館（上海田林路1號）

住宿： （沒有強行規定，可以自訂酒店，住宿費用自理）

田林賓館，標準間（含早）380元/人、合住190元/人，費用自理。合住的學員最後出現單人無法安排的情況，需要自補房間差價。

注 冊 費 用：

2400元/人。授課期間發放紙質邀請函（蓋章）和發票。按交費先後順序確定座位號。會務期間提供午餐，晚餐自理。

付 款 方 式：

1，轉賬或支付寶：您可以按照下面的指定賬號放心匯款，匯款前您也可以和招生老師核對賬戶

2，現場刷卡或現金：您也可以現場刷卡和支付現金。

A：匯款賬戶

賬戶名稱：上海服淡信息科技有限公司

賬戶號：31578103002581719

開戶行：上海銀行桃浦支行

B：支付寶轉賬

收款人：wybiot@163.com 戶 名:上海瑋瑜生物科技有限公司

匯款時寫上您的姓名，如果朋友代付一定要註明您本人的名字，便於好查詢。

疑 問 咨 詢：

聯繫人：謝老師13611825136

報名郵箱： wybiot@126.com

報名方式

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