PNAS實驗小鼠遺傳差異花名冊：36個最關鍵小鼠品系

本文轉載自「生物通」

多年來，實驗室小鼠對我們幫助良多，解答了許多醫學上的問題，但是越來越多的研究表明許多實驗室小鼠存在差異，這種不同品系的遺傳差異會大大的影響實驗結果。來自比利時根特大學的研究人員近期公布了一個包含36個最受歡迎和最重要的實驗室小鼠近交系的蛋白資料庫，這將對於了解實驗室小鼠差異，以及更好的設計實驗具有重要意義。

這一研究成果公布在8月7日的PNAS雜誌上。

一個世紀之前，科學家們就通過近親交配獲得了實驗室小鼠，這些小鼠的基因組都是純合的，因此後代在遺傳上與父母相同，這樣研究人員就能了解他們引入到小鼠中出現的不同遺傳變化造成的影響。而且實驗室小鼠易於操控和繁殖，成本相對便宜，而且有強大的遺傳模型、行為模式和基因組測序序列，因此被廣泛應用於實驗研究中。

C57BL/6小鼠，也被稱為C57 black 6或者簡稱Black 6，有品系穩定和易於繁殖的優點，也是第一個測序的小鼠基因組，此後Sanger研究所的科學家對其他最常用的近交系小鼠的基因組也進行了測序。在最新這篇文章中，Claude Libert等利用這些資料庫，將實驗室小鼠C57BL/6J的編碼序列與其它實驗室小鼠品系進行了比對，從中確定了哪些蛋白可能存在缺陷。

研究人員在36個品系中分析了B6參考序列，以及插入，缺失和單核苷酸多態性（SNPs），通過計算突變，將DNA密碼翻譯成對應的氨基酸序列，預測預測每種基因的突變如何影響翻譯所得的蛋白質。

德國亥姆霍茲感染研究中心Klaus Schughart（未參與該項研究）指出，這一資料庫中的數據是公開的，但是並不都在一個地方。但處理來自多個位置的數據需要「相當多的專業知識。不過這樣產生的資源能幫助研究人員更容易找到遺傳變異和表型後果之間的重要聯繫。」

這一資料庫也能幫助研究人員更多地了解已經用於研究疾病的小鼠，或者如果他們對特定基因感興趣，他們可能會發現包含一個基因突變的小鼠近交系，從而利用這一品系來研究這一基因。資料庫的另一個應用就是幫助可能調控特定表型的候選基因排序。

Libert實驗室的博士生Timmermans說，資料庫的局限性在於它不包含基因組非編碼區域突變的信息。

Timmermans說：「我們正在研究非編碼序列，但是我們並不確定這是否會成功，因為非編碼序列很重要，它們在物種中要比編碼序列更為保守。」

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