居然還有這種操作？

「相見不如懷念，從此

你一個人做實驗

而我

文章早就接收了

相見不如懷念，從此

你一個人寫文章

而我

早就可以畢業了

相見不如懷念，從此

你一個人奮鬥

而我

要跟著吳彥祖去歐洲游

哈哈哈哈哈哈哈」

題目：666 作者：機智的怪阿姨 寫於2012年

來自怪阿姨的凝視

而對於5分畢業的同學真心是傷不起啊！

夢熊就覺得：與其懷念不如相見

早晚都能踏上怪阿姨的康庄大道，雖然怪阿姨已經開上自己的「法拉利」

「5分嘛，跟著小張、依凡學好技能和套路，大家都可以很easy滴。不信就繼續往下看嘛！」

真的有

o0O0o

戊辰日，暴雨

黃曆上寫著宜：祈福；忌：置產

這置產真心不宜，那麼就祈福吧

保佑大家實驗順利、文章順利、畢業順利吧

話說前天，CDD上online了一篇文章，越發覺得CDD真心對我們很nice呢（對CDD雜誌不了解的，可以點我查看哦）。

文章信息如下：

Long noncoding RNA CRNDE stabilized by hnRNPUL2 accelerates cell proliferation and migration in colorectal carcinoma via activating Ras/MAPK signaling pathways.（Cell Death and Disease(2017) 8, e2862; doi:10.1038/cddis.2017.258）

CRNDE在2011年就已經報道了，是一條在結直腸癌中高表達的lncRNA。所以說，分子不算新，且有了幾十篇文章報道，主要集中在結直腸癌及膠質瘤方面的研究。

本文首先驗證了CRNDE在結直腸癌中的高表達，且與臨床分期及預後存在相關性，具有統計學意義。在CRC細胞株中驗證了CRNDE具有促癌功能。接著機制方面，發現CRNDE與hnRNPUL2形成功能複合物，維持了CRNDE的穩定性。最後通過數據挖掘及qPCR驗證表明，CRNDE干擾能引起Ras/MAPK通路基因的下調。

本項目主要使用了以下一些方法與技能：

1、RT-PCR驗證分子的表達丰度

2、SPSS統計分析

3、細胞動物實驗

4、RNA pulldown、RIP

5、數據挖掘

直接過一遍文章的思路吧：

1、分子的選擇

本項目中分子是直接選擇已報道的CRNDE（所以說英雄不問出處，分子不問來路，不管你是測序、晶元還是從以前研究中扒出來的），只要能做出東西來就是好分子。作者重新在結直腸癌樣本及細胞株中進行了表達驗證，發現其水平相對於正常組織或結直腸上皮細胞，其丰度是顯著上調的。

2、臨床相關性

CRNDE的表達與臨床TNM分期相關；CRNDE表達越高臨床預後越差。數據表明CRNDE可以作為獨立的預後因子。

3、細胞及動物實驗

RNA干擾實驗驗證了CRNDE對細胞的增值、遷移以及侵襲的影響。通過體內實驗表明CRNDE能促進結直腸癌增值及轉移的功能。

4、機制內容

通過RNA pulldown加質譜以及RIP實驗，發現CRNDE與hnRNPUL2存在結合作用。通過干擾或過表達CRNDE實驗發現，CRNDE能影響hnRNPUL2的胞漿定位，而胞漿中的hnRNPUL2能維持CRNDE的穩定性。

5、數據挖掘

為了確定CRNDE的靶基因以及其在結直腸癌發生過程中的激活機制，作者挖據了GSE89985的數據，KEGG分析表明RAS/MAPK通路是CRNDE下調的主要相關通路，並且在CRNDE干擾細胞中MAPK通路同樣失調。通過qPCR驗證了21個RAS通路的基因，確定了與晶元數據挖據的結果一致，於是推測挖據的數據可信。

這篇文章結合了常規的研究思路以及資料庫挖掘的內容。

對常規研究思路還很模糊的，沒關係，小張手把手教你！！！

關注後獲取《科研修鍊手冊》1.0、2.0、3.0、4.0、基金篇精華合集

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