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新疆地區維吾爾族單純性先天性心臟病患者GATA4基因突變分析

新疆地區維吾爾族單純性先天性心臟病患者GATA4基因突變分析


張為民,李 劍,阿布都沙拉木·吐爾遜,葉爾買克·唐沙爾汗,

買買提艾力·艾則孜,阿依別克·乃比,常冬慶,張總剛

(新疆維吾爾自治區人民醫院心外科,烏魯木齊830001)

摘要:目的 探討新疆維吾爾族單純性先天性心臟病( congenital heart disease,CHD)與GATA4基因突變的關係。方法 對1 65例維吾爾族單純性CHD患者(CHD組)和1 65例維吾爾族體檢健康者(對照組)血液樣本進行DNA提取、目的基因PCR反應及測序,與GeneBank和英國人類基因突變資料庫(HGMD)進行比較以識別基凶突變,並對氨基酸序列進行分析。結果 CHD組3例檢出致病GATA4基因突變,具體為c.1138 G>A(p.Val380Met),c.1180 C>A(p.Pr039/IThr),c.1220 C>A(p.Pr0407Gln),其中1例房間隔缺損患者攜帶p.Pr0394Thr突變為1個新突變,1例窒間隔缺損患者同時攜帶p.Val380Met和p.Pr0407Gln突變,臨床罕見;對照組均未發現GATA4基因突變。結論 新疆維吾爾族單純性CHD患者GATA4基因突變率較低,GATA4基因突變可能是部分CHD患者的病因。

關鍵詞:先天性心臟病;基凶突變;GATA4基凶;維吾爾族

先天性心臟病(congenital heart disease,CHD)是指胎兒期心臟血管發育異常而導致的心血管畸形,在嬰幼兒出生缺陷中居首位,也是新生兒非感染性疾病死亡的首要因素,發病率約8‰~12‰,且呈逐年遞增趨勢。CHD發病機制目前尚未闡明,主要由環境因素、遺傳因素或二者共同作用引起。目前已證實多個基因突變或表達失調與CHD發病相關。

GATA4基因是與心臟發育密切相關的轉錄因子之一,基因突變後其蛋白的轉錄活性下降,通過調控a-MHC,cTnC,ANF,Myl3等心臟發育相關因子來影響心臟發育,並引發CHD。CHD具有顯著的遺傳異質性,不同人群致病基因/突變並不相同。本研究探討新疆地區維吾爾族單純性CHD患者GATA4基因突變情況,報道如下。


1 資料與方法

1.1 一般資料 2013年1月 201 6年1月新疆自治區人民醫院診治單純性CHD患者1 65例(CHD組),男76例,女89例;年齡3個月~61歲,中位年齡29歲;均為維吾爾族,無血緣關係;單純性CHD經超聲心動圖和外科手術確診,其中房間隔缺損( atrialseptal defect,ASD) 120例,室間隔缺損(ventricularseptal defect,VSD) 40例,動脈導管未閉(patentductus ateriosus,PDA)3例,肺動脈狹窄(pulmonarystenosis,PS)2例。排除標準:有其他先天畸形者;染色體異常或綜合征型心血管異常者。同期1 65例維吾爾族體檢健康者為對照組,男78例,女87例;年齡4個月~60歲,中位年齡29歲。2組年齡、性別比例差異無統計學意義(P>0.05)。本研究經新疆維吾爾自治區人民醫院倫理委員會審批通過,研究對象或監護人均簽署知情同意書。

1.2方法

1.2.1 血液標本採集和基因組DNA提取 2組均採集外周血5mL,EDTA抗凝,應用基因組DNA抽提試劑盒(QIAGEN DNeasy Blood&Tissue Kit,天根生化科技北京有限公司)提取全血基因組DNA,-20℃存放備用。

1.2.2 PCR反應 採用Primer 5.O軟體設計引物,使擴增產物完全覆蓋GATA4基因的不同區域。共設計6對引物,由英濰捷基(上海)貿易有限公司合成(表1)。PCR反應體系為20 ruL,其中基因組DNA 2ruL,PCR體系(Goldstar Best MasterMix,北京康為世紀生物科技有限公司)10_uL,水6_uL,GATA4上、下游引物各1 ruL。擴增條件:預變性95℃10 min,變性95℃30 s,退火64℃30 s,延伸72℃90 s,循環35次,延伸72℃10 min。PCR產物用體積分數1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測確認。

新疆地區維吾爾族單純性先天性心臟病患者GATA4基因突變分析

1.2.3DNA測序及突變分析 PCR擴增產物均採用DNA膠回收試劑盒(天根生化科技北京有限公司)進行純化,應用AB13 730XI。全自動DNA測序儀進行序列測定。將測序結果與美國國立生物技術信息中心( National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GenBank資料庫、英國人類基因突變資料庫( HGMD)中GATA4基因標準序列(NM_002052)進行比對,明確核苷酸變異的位點和類型。在國內外資料庫如PubMed資料庫,中國知網CNKI資料庫和萬方資料庫檢索有關GATA4基因的文獻,確認突變是否已有報道。


2 結 果

2.1 GATA4基因突變篩查結果 對照組均未發現GATA4基因突變。CHD組3例發生GATA4基因突變:1例ASD患者發生c.1138G>A雜合錯義突變,即其編碼核苷酸序列第1138位的鳥嘌呤( guanine,G)變為腺嘌呤(adenine,A),引起380位氨基酸密碼子由GTG變為ATG(圖1),使相應氨基酸發生改變(p.Val380Met)而造成錯義突變;1例ASD患者發生c.1180 C>A雜合錯義突變,即其編碼核苷酸序列第1180位的胞嘧啶( cytosine,C)變為A,引起394位氨基酸密碼子由CCC變為ACC(圖2).使相應氨基酸發生改變(p. Pr0394Thr)而造成錯義突變;1例VSD患者發生c.1138 G>A和c.1220 C>A 2個雜合錯義突變,其中c.1220 C>A突變致使第1220位的C變為A,引起407位氨基酸密碼子由CCA變為CAA(圖3),使相應氨基酸發生改變(p.Pr0407Gln)而造成錯義突變,導致蛋白結構發生相應改變。

新疆地區維吾爾族單純性先天性心臟病患者GATA4基因突變分析

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2.2 3個GATA4基因突變在進化上的保守性分析與人(NP_002043.2)、大鼠(NP_032448. 2)、小鼠(NP一653331.1)、狗(XP一543205.2)、黑猩猩(XP_508070.2)和雞(XP_420041.1)多物種GATA4基因編碼氨基酸序列比對結果顯示,GATA4基因編碼的第407位的脯氨酸在進化上高度保守,而第380位的纈氨酸和第394位的脯氨酸並不高度保守。


3討 論

心臟發育是個極其複雜的動態過程,涉及多個轉錄因子在胚胎髮育過程中不同時間、不同空間的先後表達和相互作用。任何1個基因結構或量的異常均可導致心臟發育異常。心臟特異轉錄因子的突變是CHD遺傳學方面的主要病因。GATA4基因是近年來發現的心臟前體細胞最早期的轉錄因子之一,在心臟發育過程中發揮重要作用。人類GATA4基因位於染色體8p23.1,全長55 757 bp,有7個外顯子,其中第1外顯子不參與編碼,其餘6個外顯子編碼442個氨基酸。GATA4基因包含一個高度保守的DNA結合區域,這個區域由2個鋅指結構( Cys-X2-Cys-X17Cys-X2-Cys)組成,在進化過程中高度保守。GATA4基因通過其鋅指結構與其他心臟特異性的轉錄因子相互作用,是心臟發生調控網路中非常重要的轉錄因子。GATA4基因首先在心前區的中胚層表達,隨後在心內膜和心肌中表達,主要參與心臟的正常發育及心原細胞在心臟的特異分化和遷移。GATA4基因正常表達對心臟的環化,心房、心室發育,房室瓣形成以及傳導系統的維持起著關鍵作用。

動物胚胎模型研究結果顯示,GATA4基因表達失活可導致各種心臟畸形,包括ASD、VSD、房室間隔缺損、右心室發育不良、心內膜墊缺損、法洛四聯症、右心室雙出口和心肌肥厚等。目前研究結果認為,GATA4基因病理性突變可引起基因產物的轉錄活性下降,影響其他心臟發育相關因子發揮作用,從而影響心臟正常發育,最終導致CHD發生。

Garg等對2個獨立的單純性CHD家系進行分子遺傳學研究,首次證實了GATA4基因突變是CHD致病因素之一。近年來對CHD患者進行GATA4基因突變篩查的報道漸多,發現GATA4基因突變極具異質性,突變涵蓋ASD、VSD、心內膜墊缺損、動脈導管未閉、肺動脈狹窄、法洛四聯症、有心室雙出口、右心室發育不良和左心發育不全綜合征等類型。國內外流行病學研究結果發現,CHD存在家族聚集現象,在CHD家系中ASD是最常見的一種攜帶GATA4基因突變的臨床表型。

本研究對維吾爾族1 65例單純性CHD患者和1 65例體檢健康者GATA4基因外顯子編碼序列進行檢測,發現對照組均未發現GATA4基因突變,3例CHD患者GATA4基因中識別jLI_1 3個雜合錯義突變p. Val380Met, p.Pr0394Thr和p.Pr0 407Gln。p.Val380Met和p.Pr0407Gln突變已有報道,但1例VSD患者同時攜帶p.Val380Met和p.Pr0407Gln突變,為首次報道。1例ASD患者攜帶p.Pr0394Thr錯義突變,經文獻檢索查詢發現此突變位點尚未見報道,該突變致使極性中性氨基酸的蘇氨酸代替了非極性氨基酸的脯氨酸,使氨基酸的性質發生變化,可能導致患者發病。

本課題組前期對62例維吾爾族CHD患者進行GATA4基因突變篩查,檢測到2種GATA4基因錯義突變p.Pr040-Gln和p.Asp425Asn,其中p.Pr0407Gln在1例法洛四聯症患者中檢出,而p.Asp425Asn存在於1例VSD患者。多物種GATA4基因編碼氨基酸序列比較分析結果表明,p.Pr0407Gln突變位點均位於GATA4基因高度保守區域。該區氨基酸的改變可能會影響GATA4基因轉錄活性。用PMut軟體和SIFT軟體對p.Pr0407Gln突變預測,發現該突變為病理性突變,並可能影響蛋白質功能,該突變可能與CHD發病相關。

通過檢索PubMed資料庫和HGMD資料庫等,目前為止共發現超過130個GATA4基因突變位點,GATA4表現出高突變性和潛在致病性,但仍缺乏基因型臨床表型相關性的研究,每種突變所對應的臨床表型尚未確定。本研究擴大了CHD相關GATA4基因的突變譜,加深了對GATA4基因突變與CHD臨床表型間關係的認識。

GATA4基因是心臟發育的重要轉錄因子,新疆維吾爾族單純性CHD患者GATA4基因突變率較低,GATA4基因突變可能是部分特發性CHD患者的病因。多數學者認為,CHD是一類多基因遺傳病,是由環境因素和遺傳因素相互作用引起的,遺傳因素在其發病中起著主導作用,僅從單純基因突變不能完全解釋基因與CHD的關係。對CHD相關的遺傳環境共同作用機制進行深入研究,有助於揭示CHD新的分子病因。



來源:選自醫學空間戰略合作夥伴《中華實用診斷與治療》雜誌,2017,31(5):431-434轉載請標明出處!

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