賽默飛定製化基因晶元——助力中國農業領域最大的基因晶元定製計劃

近年來，隨著分子標記檢測技術不斷發展，分子育種進入了全基因組選擇時代。相對於傳統育種手段，全基因組選擇能顯著提高估計育種值準確率、縮短育種年限，已應用於奶牛、生豬的品系選育以及重要作物品種改良中。Thermo Fisher基因晶元平台在農業分子育種方向不斷創新，晶元數據穩定性、有效性和檢測通量靈活性等多項指標引領分子育種行業。

近日，北京康普森生物技術有限公司（簡稱：康普森）宣布聯合Thermo Fisher生物基因晶元平台，依託包括中國農業大學、中國農業科學院畜牧獸醫研究所和中國農業科學院作物科學研究所等單位的國內頂級農業科研院所的技術支撐，啟動中國首個十萬樣本基因晶元定製計劃。

該項合作充分利用了Thermo Fisher基因晶元平台在農業基因分型晶元方面的強大技術優勢和定製化經驗。晶元製造的一致性，無SNP丟失或批間差，及Thermo Fisher公司的專業定製能力，成為合作成功的決定因素。

此前，康普森已經在Thermo Fisher基因晶元平台成功開發了中國首款雞55K晶元，豬55K晶元等。這些分型方案是基因組選擇的關鍵，可應用於家畜、家禽和植物等具有重要經濟意義物種的分子育種。

該十萬樣本首期定製晶元計劃涵蓋了豬、雞、大豆等重要農業經濟物種，在Thermo Fisher基因晶元分型平台設計中國品種特有信息的檢測位點，晶元位點信息涵蓋相關領域科學家多年的研究成果，位點信息主要分為4部分：

GWAS和QTL分析數據（30%）

亞洲品種特異的SNP位點（10%）

最新的中外品種高通量測序數據（20%）

現有的商品化晶元位點（40%）等

形成一系列適合中國農業分子育種研究的專有晶元，用於檢測生長性狀、繁殖性狀、抗病性狀及飼料報酬等多個重要經濟指標。

Thermo Fisher基因晶元分型平台對每個物種的不同性狀進行精細的探針設計，多態性位點的基因組平均分布，已有商業化晶元的有效位點覆蓋，自有資料庫的驗證位點比對以及靈活的檢測通量，充分優化定製晶元設計，確保了定製晶元的通用性、最大化的數據可利用性和全基因組選擇育種的最佳性價比，同時滿足中國農業分子育種科研工作者及企業的需求。

該計劃第一期與國內數十家育種領軍企業合作，共同建立豬、雞、大豆的分子育種產業檢測平台，Thermo Fisher的Axiom 384HT平台能夠快速、持續和經濟地生成高質量的基因分型數據，滿足檢測平台常規行業檢測的所有需要。

Thermo Fisher在成功開發基因分型方案方面積累了大量寶貴的經驗。Thermo Fisher定製晶元基於原位光蝕刻技術，無標記批間差和數據丟失，靈活靶向不同標記，支持將多個物種設計到一張晶元上，完美支持多倍體物種的設計。靈活多樣的探針設計策略，以及生物信息學團隊直接和客戶互動完成設計，保證了高質量的晶元產品和數據表現。

目前已經完成了幾十個農業定製晶元，廣泛應用於目標性狀位點及功能基因定位、分子育種、群體基因組學分析、品種資源鑒定等領域。國內的小麥，玉米、水稻、大豆等研究領軍人物，均與Thermo Fisher開展廣泛深入的合作，開發了Wheat660K，Maize200K，Maize55K，Rice55K，Soybean355K等多款定製化基因分型晶元，這些晶元在相應研究和產業領域廣受好評。

基因晶元開發及檢測流程

實驗流程方面，GeneTitan平台整合了掃描儀、洗滌工作站和雜交爐，整個流程自動化，無需手動的晶元處理和成像，排除了人為誤差，提高了工作效率和準確度。Axiom Analysis Suite圖像化軟體自動完成從原始數據到基因分型結果的數據分析流程，並能給出聚類成簇圖，支持二倍體和多倍體物種的自動基因分型，無需人工校正，支持各種通用格式的數據輸出。

靈活的定製晶元格式和通量

Thermo Fisher基因晶元平台的基因分型方案為客戶提供了可定製、經濟高效且自動化的基因分型工具，其靈活的定製格式和通量為客戶提供了多種多樣的選擇，創新的設計策略和先進的生物信息學軟體能夠對二倍體和多倍體基因組進行自動基因分型和聚類，高度準確地鑒定、驗證和篩選與理想的遺傳性狀相關的遺傳標記。

Thermo Fisher是基因分型晶元定製化的領導者，在農業研究領域也提供了多款利用專家設計項目設計而來的動植物目錄晶元。

關於Thermo Fisher基因晶元平台在農業基因組上的更多應用，請訪問：https://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/microarray-analysis/agrigenomics-solutions-microarrays-gbs/axiom-genotyping-solution-agrigenomics.html

Thermo Fisher致力於提供整體解決方案，為更清潔、更安全、更健康的中國做一份貢獻。

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