最新成果!NgAgo可抑制乙肝病毒複製,但不是通過「基因編輯」
2016年5月2日,河北科技大學副教授韓春雨課題組在Nature Biotechnology上發表了關於NgAgo基因編輯技術的論文,引發了科學界的強烈關注。然而,從一開始被認為是顛覆性的技術,到不久後大批科學家表示無法重複這一研究成果,現在,NgAgo是否具有「基因編輯」功能還是個大大的問號。
圖片來源:Nature Biotechnology
關於這一事件的最新動向還停留在今年5月。5月9日,Nature Biotechnology(NBT)發布了一則「編輯部關切」。文中稱,NBT的編輯注意到了讀者們對有關NgAgo論文重複性的擔憂。此前NBT雜誌也發布了韓國、德國、美國三個小組的研究結果(http://dx.doi.org/10.1038/nbt.3753)。他們試圖重複原始論文中關鍵的Figure 4中的結果。然而,沒有一個小組在任何位點或任何條件下觀察到任何由NgAgo誘導的突變。此外,另一個不同研究小組也在Protein & Cell雜誌上報道了相似的結果(doi:10.1007/s13238-016-0343-9)。(推薦閱讀:中外20家實驗室發表學術論文聲稱無法重複韓春雨實驗)
NBT編輯部稱,他們已經與原始論文的作者們進行聯繫。作者們正在調查研究結果缺乏重複性的潛在原因,並已被通知NBT會發表這則聲明。一旦相關調查完成,NBT將會更新最新的進展。
同月20日,央視CCTV13《新聞調查》欄目用43分鐘的長視頻對截止到當時的事件發展過程和最新進展進行了報道。(推薦閱讀:韓春雨獨家回應:為什麼「我的成功」無法複製?| 央視43分鐘長視頻)之後的兩個月,鮮有關於這一事件的最新報道。
最新成果:NgAgo可抑制乙肝病毒複製
近日,小編注意到,一個中國研究團隊發表了一項關於NgAgo的新成果。首先需要強調的是,該研究也未證實NgAgo的基因編輯功能。
圖片來源:Antiviral Research
具體來說,7月11日,發表在Antiviral Research雜誌上題為「NgAgo-gDNA system efficiently suppresses hepatitis B virus replication through accelerating decay of pregenomic RNA」的論文中,來自山東大學等機構的研究人員證實,NgAgo-gDNA系統能夠通過促進pgRNA(pregenomic RNA)的降解有效抑制乙肝病毒的複製。
該研究在結論中稱,這一研究結果首次證明了NgAgo/gDNA在抑制乙肝病毒複製方面的潛力。研究發現,抑制效果明顯與gDNA靶向區域(gDNA targeting region)有關。此外,儘管HBsAg(hepatitis B surface antigen,乙肝表面抗原)、HBeAg(hepatitis B e-antigen,乙型肝炎E抗原)和pgRNA的水平明顯下降,但作者們未能檢測到NgAgo的任何DNA編輯能力。最後,作者們證明,NgAgo/gDNA顯著縮短了乙肝病毒pgRNA的半衰期。他們認為,這些結果為將NgAgo/gDNA系統用於控制病毒感染提供有趣的線索。
前情回顧:基因敲低、切割RNA,反正就不是基因編輯
圖片來源:Cell Research
事實上,關於NgAgo的「非基因編輯」功能,去年Cell Research 雜誌上的一篇論文也有報道。在這篇題為 NgAgo-based fabp11a gene knockdown causes eye developmental defects in zebrafish 的文章中,南通大學神經再生重點實驗室副教授劉東團隊觀察到,NgAgo 確實可以改變斑馬魚的表型,但這並非是通過基因編輯實現的。團隊通過實驗得出結論,NgAgo 系統可以在不改變目標基因序列的情況下,對基因表達實現 knockdown(即下調其目標 mRNA 表達水平),且這可能與 NgAgo 的基因剪切活性沒有關係。
圖片來源:BioRxiv
此外,今年1月,在生命科學預印本網站BioRxiv上,來自韓國的一個研究小組發表的題為「DNA-dependent RNA cleavage by the Natronobacterium gregoryi Argonaute」的成果指出,NgAgo能作為一種DNA引導的核酸內切酶切割RNA,而不是DNA。這意味著NgAgo或許可以作為「RNA干擾」的一種工具發揮作用。
參考資料:
Editorial Expression of Concern: DNA-guided genome editing using the Natronobacterium gregoryi Argonaute
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